O diagnóstico de laboratório da doença de Chagas apresenta elevado grau de complexidade. Fatores relacionados com a resposta imune do hospedeiro e fatores relacionados com as diferenças antigênicas do parasita devem ser considerados para a avaliação final do resultado. Métodos parasitológicos ou imunológicos para a pesquisa de T. cruzi ou de seus componentes em diferentes fluidos biológicos e testes sorológicos para a pesquisa e quantificação de diferentes classes de imunoglobulinas têm sido padronizados visando o diagnóstico das diferentes fases, aguda, intermediária ou inaparente e crônica da doença. Dos métodos parasitológicos, o xenodiagnóstico, natural ou artificial, é o mais utilizado, embora na fase crônica somente 50% dos casos sejam detectados. Nos testes sorológicos, ênfase tem sido dada a imunofluorescência indireta para a pesquisa de anticorpos IgG e IgM, ao teste de hemaglutinação, pelo baixo custo e ao teste imunoenzimático, pela possibilidade de automação. Dado que os resultados obtidos nos testes sorológicos fornecem diagnóstico de probabilidade, fatores como a prevalência da doença e a sensibilidade e especificidade dos testes devem ser considerados. A possibilidade da utilização de antígenos definidos, obtidos por métodos físico-químicos, biologia molecular ou síntese, abre perspectivas para a padronização de testes com alta especificidade, sem perda significativa da sensibilidade.