An efficient method for total RNA extraction from leaves of arboreal species from the Brazilian Cerrado

Resumo

Considerando a falta de informação para extração de RNA de plantas arbóreas, especialmente as do Cerrado brasileiro, o objetivo do estudo foi testar métodos de extração de RNA para uma ampla variedade de espécies de plantas nativas deste bioma. Os métodos testados foram: (i) reagente TRIzol®, (ii) reagente TRIzol® com modificações, (iii) tampão CTAB e (iv) tampão CTAB modificado, inicialmente para amostras foliares de Xylopia aromatica e Piper arboreum. O procedimento com melhores resultados foi utilizado posteriormente para obtenção de RNA de 17 outras espécies nativas. Baseado na razão de absorbância A260/A280 o método com CTAB modificado mostrou-se melhor para extração de RNA destas espécies arbóreas. Dez das onze espécies testadas por meio de RT-PCR geraram fragmentos de tamanho esperado a partir do RNA total extraído utilizando o método selecionado, confirmando-o como melhor opção para obtenção de RNA de alta qualidade para análises moleculares e para uso na detecção de vírus infectando essas espécies arbóreas.

Palavras-chave:
Bioma Cerrado; cDNA; RT-PCR; espécies lenhosas