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Journal of the Brazilian Chemical Society

versão impressa ISSN 0103-5053

Resumo

FISHER, Luke S.  e  GUNER, Osman F.. Seeking novel leads through structure-based pharmacophore design. J. Braz. Chem. Soc. [online]. 2002, vol.13, n.6, pp. 777-787. ISSN 0103-5053.  http://dx.doi.org/10.1590/S0103-50532002000600008.

Neste artigo mostramos um procedimento desenvolvido em nossos laboratórios que identifica "novos" compostos biologicamente ativos distintos de compostos previamente conhecidos no que diz respeito à especificidade da ação e outras características. O procedimento envolve o mapeamento de uma série de compostos ativos (série de treinamento), através de interações lipofílicas e de ligações hidrogênio com o sítio de uma enzima ativa. As interações identificadas e mapeadas são, então, removidas (com exceção daqueles sítios de interação criticamente importantes) e, apenas as interações não utilizadas pelos compostos ativos são mantidas. Os modelos farmacofóricos são gerados e escalonados para os sítios previamente enumerados. Esse modelo é então usado para varreduras de bancos de dados tridimensionais e identificação de novas substâncias matrizes. Este procedimento foi aplicado para inibidores da protease do vírus HIV-1. Vários compostos com atividade moderada na ordem de "micro"(letra mi)Molar foram selecionados pelo modelo farmacofórico proposto.

Palavras-chave : pharmacophores; structure-based design; 3D databses.

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