Onze amostras de sistema nervoso central de cães coletados entre 2000 e 2004 foram positivas pela RT-PCR, a qual amplificou um fragmento de 480pb do gene N do vírus da cinomose canina (VCC). A análise filogenética baseada na seqüência parcial do gene N mostrou quatro principais agrupamentos genéticos. Todas as amostras de cães segregaram no agrupamento I, com identidade média de nucleotídeos de 95,8% e 95,6% com as amostras vacinais Onderstepoort e Lederle, respectivamente. O agrupamento II agregou todas as amostras relacionadas aos guaxinins. O agrupamento III agregou amostras orientais e o agrupamento IV agregou as amostras vacinais Onderstepoort e Lederle, com identidade média de nucleotídeos de 99,7% entre elas. Este é o primeiro relato de análise filogenética de amostras de VCC no Brasil.
cão; vírus da cinomose canina; RT-PCR; filogenia
