Transferibilidade de marcadores microssatélites para Syagrus harleyi (Mart.) Becc. (Arecaceae), uma espécie endêmica da Chapada Diamantina, um hotspot de biodiversidade no Nordeste do Brasil

Lazarino, Leydiane da Conceição; Pereira, Derval Gomes; Silva, Lorena Souza; Souza, Renata Miranda; Galdino, José Henrique; Waldschmidt, Ana Maria

doi:10.1590/0103-8478cr20250171

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BIOLOGY • Cienc. Rural 56 (7) • 2026 • https://doi.org/10.1590/0103-8478cr20250171 linkcopiar

Transferibilidade de marcadores microssatélites para Syagrus harleyi (Mart.) Becc. (Arecaceae), uma espécie endêmica da Chapada Diamantina, um hotspot de biodiversidade no Nordeste do Brasil

Autoria SCIMAGO INSTITUTIONS RANKINGS

Syagrus harleyi é uma palmeira acaulescente endêmica da Chapada Diamantina (Bahia, Nordeste do Brasil), um hotspot de biodiversidade na América do Sul. A área de ocorrência da espécie tem sido afetada por incêndios e pela fragmentação da paisagem. Porém, sua diversidade genética permanece desconhecida. Este estudo avaliou a transferibilidade de 19 primers de microssatélites (SSR) desenvolvidos para três espécies filogeneticamente próximas a S. harleyi, em 30 indivíduos de três populações. Foram identificados 10 loci polimórficos, com média de 4,1 alelos por locus e heterozigozidade esperada e observada de 0,579 e 0,780, respectivamente. Estes resultados demonstram a eficiência da transferibilidade desses loci o potencial informativo dos mesmos para acessar a diversidade genética em populações de S. harleyi, o que contribuirá para o manejo e a conservação dessa espécie.

Palavras-chave:
palmeira; espécie endêmica; caatinga; SSR; amplificação cruzada

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[TFN1] Note: “F” and “R” refer to nucleotide sequences of forward and reverse SSR primers, respectively. Ta: optimal annealing temperature (ºC) of each primer pair; Na: total number of alleles for each SSR locus; He: expected heterozygosity; Ho: observed heterozygosity; HWE = Hardy-Weinberg equilibrium, where ns refers to non-significant, whereas asterisks refer to the level of significance (^*P < 0.05, ^**P < 0.01, ^***P < 0.001) in HWE equilibrium based on Chi-square statistics; F_IS: inbreeding coefficient.

[TFN2] ^aSSR primers developed by BILLOTTE et al. (2004).

[TFN3] ^bSSR primers developed by RODRIGUES et al. (2004).

[TFN4] ^cSSR primers developed by RIVERA et al. (1999).

[TFN5] ^dSSR primers developed by PERERA et al. (1999).

[TFN6] ^eSSR primers developed by GAIOTTO et al. (2001).

Locus	Source species	---------Primer sequence 5’- 3’---------	Size range (bp)	Ta (ºC)	Na	He	Ho	HWE	F_IS
mBgCIR091^a	Bactris gasipaes	F:CAAGAACAGGCTCAGTCTA	93-167	56	4	0.618	0.635	ns	-0.038
		R: TGCAATCAACCCAAGAT
Bg02-09^b	Bactris gasipaes	F:CGCAGCAGCAGCAATAAATA	92-166	56	5	0.514	0.921	^*	-0.794
		R: TCCAGCAACTTTCAGTCGAG
Bg02-10^b	Bactris gasipaes	F: ATTGGGTCCAGATCCTCTTT	187-190	58	3	0.549	0.926	ns	-0.686
		R: GTGGCACACATGGGGTTC
mBgCIR066^a	Bactris gasipaes	F: GCATGTTGCATTGACTA	93-164	50	4	0.644	0.886	^**	-0.497
		R: GAATCCTGGTTCAGATACT
CNZ10^c	Cocos nucifera	F:CCTATTGCACCTAAGCAATTA	93-160	56	3	0.621	0.880	^*	-0.451
		R: ATGATTTTCGAAGAGAGGTC
CNZ51^d	Cocos nucifera	F:CTTTAGGGAAAAAGGACTGAG	160-242	56	8	0.524	0.870	^*	-0.676
		R:ATCCATGAGCTGAGCTTGAAC
CNZ57^d	Cocos nucifera	F:AGTGACAGCTCAAAGCAGTAT	97-131	58	4	0.580	0.666	ns	-0.565
		R:GTGGAGTACACAACCTATGGA
CNZ04^c	Cocos nucifera	F: CCTATTGCACCTAAGCAATTA	79-136	56	4	0.560	0.792	^***	-0.392
		R: TGATTTTCGAAGAGAGGTC
CNZ50^d	Cocos nucifera	F: TCGACTAAGTGTTGTCCATTC	93-100	60	3	0.542	0.703	^*	-0.187
		R: ATCCATCCAGGATCCCAATAT
EE54^e	Euterpe edulis	F: CATGTATCTAAGGAACAAGG	128-137	58	3	0.638	0.523	ns	0.087
		R: CTGTGCTCTCTCATTCTCA
Mean					4.1	0.579	0.780		-0.420