Brazilian Journal of Biology, Volume: 67, Issue: 4 Supplement, Published: 2007
  • Editorial note

    Galetti Jr, Pedro M.
  • Genetic diversity of two Brazilian populations of the Pampas deer (Ozotoceros bezoarticus, Linnaeus 1758)

    Rodrigues, FP.; Garcia, JF.; Ramos, PRR.; Bortolozzi, J.; Duarte, JMB.

    Abstract in Portuguese:

    O Veado-campeiro (Ozotoceros bezoarticus) é uma das espécies de cervídeos neotropical mais ameaçadas devido à destruição de seu hábitat e conseqüente redução e isolamento de suas populações. Marcadores do tipo RAPD (Random amplified polymorphic DNA) foram utilizados na análise da divergência populacional e estimativa da variação genética dentro e entre duas populações correspondentes a diferentes subespécies. Os marcadores RAPD mostraram uma variação genética substancial, sendo que as 105 bandas polimórficas obtidas pelo uso de 15 primers produziram fenótipos únicos para todos os indivíduos analisados. Para avaliar o nível de diferenciação entre as populações, foi realizada uma análise da variância molecular (AMOVA) e uma análise de agrupamento utilizando o método de neighbor-joining. Nenhuma diferenciação foi observada, sendo aproximadamente 96,0% da variação encontrada atribuída à variação dentro das populações estudadas. Este resultado difere do obtido através da análise da região controle do mtDNA, e é discutido levando-se em consideração as diferenças genéticas entre os diferentes marcadores utilizados e o padrão de dispersão geralmente observado nas espécies de mamíferos (realizada principalmente pelos machos). Os dados aqui apresentados poderão ser úteis para futuros estudos taxonômicos e genéticos desta espécie, para o monitoramento da variação genética observada em suas populações e para o desenvolvimento de estratégias de manejo para sua conservação.

    Abstract in English:

    The Pampas deer (Ozotoceros bezoarticus) is one of the most endangered Neotropical cervid with populations that have been drastically reduced to small and isolated ones, mainly because of its habitat destruction. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers were used to analyze population divergence and genetic variation within and between two populations corresponding to distinct subspecies. The RAPD markers displayed substantial genetic variation with all animals possessing unique RAPD phenotypes over 105 polymorphic bands produced by 15 primers. An analysis of molecular variance (AMOVA) and a neighbor-joining cluster analysis were performed to assess levels of differentiation between populations. No differentiation was recorded and about 96.0% (P < 0.00001) of the total variance was attributable to variation within populations. This result is quite distinct from data obtained by the analysis of the mtDNA control region, and is discussed on the basis of genetic differences between the different markers and the male-biased dispersal patterns generally observed in the mammal species. The data presented herein are potentially useful for future taxonomic and genetic studies in this species, for the monitoring of the genetic variation observed within these populations, and for the development of management guidelines for its conservation.
  • Genetic diversity of the Neotropical otter (Lontra longicaudis Olfers, 1818) in Southern and Southeastern Brazil

    Trinca, CS.; Waldemarin, HF.; Eizirik, E.

    Abstract in Portuguese:

    A lontra Neotropical é uma das espécies de lontras menos conhecidas e apresenta diferentes graus de ameaça ao longo de sua distribuição geográfica. Pouca informação existe a respeito de aspectos ecológicos desta espécie e nenhum estudo genético foi publicado até o momento, dificultando a delimitação de estratégias adequadas de conservação para suas populações. Para contribuir com informação genética aos esforços de conservação de L. longicaudis, a diversidade molecular da porção 5’ da região controladora do DNA mitocondrial foi caracterizada em amostras desta espécie coletadas nas regiões Sul e Sudeste do Brasil. A análise das seqüências revelou um alto nível de diversidade haplotípica (h = 0,819; SE = 0,0052) e variabilidade nucleotídica entre 0,0039 a 0,0067. Um dos haplótipos encontrados foi o mais comum em ambas as regiões e, desta seqüência, diversos outros haplótipos (de ocorrência restrita) podem ter se derivado através de mutações pontuais. Nenhuma diferenciação genética significante foi observada entre as regiões Sul e Sudeste.

    Abstract in English:

    The Neotropical otter is one of the least known otter species, and it is considered to be threatened to various degrees throughout its geographic range. Little information exists on the ecological characteristics of this species, and no genetic study has been published about it until now, hampering the design of adequate conservation strategies for its populations. To contribute with genetic information to comprehensive conservation efforts on behalf of L. longicaudis, we characterized the molecular diversity of the 5’ portion of the mtDNA control region in samples from this species collected in Southern and Southeastern Brazil. The sequence analysis revealed a high level of haplotype diversity (h = 0.819; SE = 0.0052) and nucleotide variability ranging from 0.0039 to 0.0067. One of the sampled haplotypes was the most common in both regions and, from this sequence, several other (locally occurring) haplotypes could be derived by single point mutations. No significant genetic differentiation was observed between the Southern and Southeastern regions.
  • Conservation genetics of the giant otter (Pteronura brasiliensis (Zimmerman, 1780)) (Carnivora, Mustelidae)

    Garcia, DM.; Marmontel, M.; Rosas, FW.; Santos, FR.

    Abstract in Portuguese:

    A ariranha (Pteronura brasiliensis) é um mamífero aquático da família Mustelidae, endêmico da América do Sul. Sua distribuição original se estendia desde as Guianas até o centro-norte da Argentina, mas está extinta ou à beira da extinção na maior parte de sua distribuição histórica. Atualmente a espécie é considerada como ameaçada de extinção pela World Conservation Union (IUCN). Em função de sua distribuição no continente sul-americano e de algumas características morfológicas, duas subespécies foram sugeridas: P. brasiliensis brasiliensis, com ocorrência nas bacias do Amazonas e Orinoco, e P. brasiliensis paranensis, ocorrendo nas bacias dos Rios Paraná e Paraguai. Inexiste, contudo, um consenso sobre a validade da divisão em subespécies e nenhum estudo detalhado foi realizado para elucidar esta questão. Este trabalho tem o objetivo de avaliar a diversidade genética e a estrutura populacional de P. brasiliensis ao longo de sua distribuição no Brasil para verificar a existência de duas subespécies baseando-se também em um critério de monofilia recíproca. A região controle e os genes do Citocromo b e da Subunidade I da Citocromo c Oxidase do DNA mitocondrial foram analisados em diversas populações de ariranha que ocorrem nas bacias dos rios Amazonas e Paraguai. As análises indicaram um grau moderado de correlação geográfica e um alto nível de divergência inter-populacional, embora a divisão em subespécies não seja bem sustentada. Como uma forte estruturação populacional foi observada, não é possível descartar a existência de outras subdivisões nesta espécie. Os resultados indicam a presença de uma estrutura populacional mais complexa em P. brasiliensis, o que implica que medidas de conservação deveriam concentrar seus esforços preservando todas as populações locais remanescentes.

    Abstract in English:

    The giant otter (Pteronura brasiliensis) is an aquatic mammal of the Mustelidae family, endemic to South America. Its original distribution corresponds to the region from the Guyanas to Central-North Argentina, but it is extinct or on the verge of extinction in most of its historical range. Currently, the species is considered endangered by the World Conservation Union (IUCN). Based on its geographic distribution in the South American continent and on some morphological characters, two subspecies were suggested: P. brasiliensis brasiliensis, occurring in the Amazon and Orinoco River Basins, and P. brasiliensis paranensis, in the Paraná and Paraguai River Basins. However, there is no consensus on assuming this subspecies division and no detailed studies have been carried out to elucidate this question. This study aims to evaluate the genetic diversity and population structure of Pteronura brasiliensis along its range in Brazil to check the possibility of the existence of two distinct subspecies using also a reciprocal monophyly criterion. We analyzed the control region, and the Cytochrome b and Cytochrome c Oxidase subunit I genes of the mitochondrial DNA in several giant otter populations from the Amazon and Paraguai River Basins. Analyses have indicated some degree of geographic correlation and a high level of inter-population divergence, although the subspecies division is not highly supported. As we observed strong population structure, we cannot rule out the existence of further divisions shaping the species distribution. The results suggest that a more complex population structure occurs in P. brasiliensis, and the conservation practice should concentrate on preserving all remaining local populations.
  • Identifying management units in non-endangered species: the example of the sloth Bradypus variegatus Schinz, 1825

    Moraes-Barros, N.; Miyaki, CY.; Morgante, JS.

    Abstract in Portuguese:

    Neste estudo nós realizamos a análise da diversidade genética da preguiça comum, Bradypus variegatus, a fim de compreender os padrões de estrutura populacional, identificar unidades intraespecíficas divergentes e contribuir para o conhecimento da biodiversidade nas florestas da região neotropical. Nós analisamos um segmento de 387 pb da região controle do DNA mitocondrial de 28 indivíduos distribuídos em diferentes localidades da Floresta Amazônica e da Mata Atlântica. Os resultados obtidos demonstram que a diversidade genética da espécie pode ser representada em seis diferentes unidades de manejo (UM). Tais UMs englobam seis linhagens filogenéticas e estão localizadas em diferentes regiões geográficas sendo elas, as porções norte e sul da Mata Atlântica, três regiões dentro da área de Floresta Amazônica e uma área de transição entre os dois domínios de mata. As diferentes unidades intraespecíficas de B. variegatus são concordantes com grupos filogeográficos e áreas de endemismo já observadas para outras espécies de vertebrados. Levando em consideração o fato de que estas UMs concordam com filogrupos e áreas de endemismo previamente descritos para outras espécies de vertebrados, o estudo da preguiça comum, uma espécie amplamente distribuída e considerada não ameaçada de extinção, pode auxiliar na identificação de áreas destinadas à conservação biológica ao longo das florestas úmidas da região neotropical.

    Abstract in English:

    In this study we propose the analysis of genetic diversity of the common three-toed sloth, Bradypus variegatus, in an attempt to understand population structure, identify divergent intraspecific units, and contribute to the knowledge of biodiversity in the neotropical forests. We analyzed a 387 bp segment of the mitochondrial DNA control region in 28 individuals distributed in different localities of both Atlantic and Amazon forests. Our results demonstrated that the genetic diversity of B. variegatus is distributed in six management units, MUs. The observed MUs encompass six phylogenetic lineages and represent respectively north and south regions of Atlantic forest, three regions within the Amazon forest, and a transition region between these two biomes. Considering the fact that these MUs are concordant with phylogroups and endemism areas already described for other vertebrate species, we can say that the study of B. variegatus, a widely distributed and not endangered species, can help to identify areas for conservation biology purposes in neotropical rain forests.
  • The conservation status of the tuco-tucos, genus Ctenomys (Rodentia: Ctenomyidae), in southern Brazil

    Fernandes, FA.; Fernández-Stolz, GP.; Lopes, CM.; Freitas, TRO.

    Abstract in Portuguese:

    O objetivo da biologia da conservação deve estar relacionado com a preservação das espécies e também com os processos evolutivos e ecológicos que foram responsáveis por sua formação e que continuam ocorrendo. Este trabalho revisa o status de conservação das espécies de tuco-tuco (Ctenomys torquatus, C. lami, C. minutus e C. flamarioni) do sul do Brasil, assim como a relação entre estas informações e a história geológica de uma região de especial importância, a planície costeira dos Estados do Rio Grande do Sul e Santa Catarina. São também discutidas as implicações do conhecimento acumulado sobre as espécies de tuco-tuco no sul do Brasil em relação aos aspectos evolutivos e a ameaça de extinção que estas espécies de roedores subterrâneos sofrem.

    Abstract in English:

    The goal of conservation biology should be related to the preservation of species and also to the evolutionary and ecological processes that were responsible to form them and that are still acting. We review the conservation status of the species of tuco-tuco (Ctenomys torquatus, C. lami, C. minutus, and C. flamarioni) from southern Brazil, and relate these data to the geological history of a particular area in that region, the Coastal Plain of the States of Rio Grande do Sul and Santa Catarina. The implications of the data on these species from the Southeastern Brazil are also discussed in relation to the evolution and risk of extinction of these subterranean rodents.
  • Genetic diversity and evidence of recent demographic expansion in waterbird populations from the Brazilian Pantanal

    Lopes, IF.; Miño, CI.; Del Lama, SN.

    Abstract in Portuguese:

    O presente estudo determinou níveis de variabilidade nuclear e mitocondrial (DNAmit) e padrões filogeográficos de populações reprodutivas de colhereiro (N = 57), cabeça-seca (N = 89) e tuiuiú (N = 30) do Pantanal brasileiro. Estas espécies foram selecionadas porque são bioindicadoras da integridade das áreas alagáveis e se encontram ameaçadas em outras partes da sua área de distribuição. Devido à sua estreita associação com esse tipo de ecossistema, seu estudo permite verificar os efeitos das mudanças climáticas do Pleistoceno nos seus padrões demográficos. Níveis de diversidade genética nuclear nas populações pantaneiras não diferiram significativamente dos encontrados em outras populações ao longo do continente americano onde são consideradas ameaçadas ou como de especial interesse para conservação. Níveis reduzidos de variabilidade genética DNAmit foram observados nas populações de tuiuiú da América Central, quando comparadas às populações do Pantanal. A expansão demográfica recente das três espécies no Pantanal ficou marcadamente evidenciada pelos padrões unimodais da distribuição das diferenças pareadas e pelo teste de neutralidade de Fs de Fu. Hipotetizamos que o tempo médio de expansão populacional (entre 30.843 e 14.233 anos antes do presente) está associado as respostas destas populações de aves às mudanças climáticas ocorridas nas áreas alagáveis durante o último período de glaciação. Recomendamos, esforços especiais na conservação das populações do tuiuiú, um programa de monitoramento genético baseado no DNAmit e a caracterização ecológica dessas espécies de aves aquáticas ao longo de suas áreas de distribuição.

    Abstract in English:

    The present study determined nuclear and mitochondrial (mtDNA) levels of genetic variability and phylogeographic patterns in breeding populations of Roseate Spoonbill (N = 57), Wood Stork (N = 89), and Jabiru Stork (N = 30), sampled in the Brazilian Pantanal. These species were selected since they are bioindicators of wetlands’ health and are threatened in other parts of their distribution. As they are in close association with this ecosystem, they are appropriate for studying the effects of Pleistocene climatic changes on their demographic patterns. Levels of nuclear genetic diversity in Pantanal populations were not significantly different from those of other populations throughout the American continent, where they are considered threatened or of special concern. Reduced levels of mtDNA genetic diversity were observed in the Central American population of Jabiru Stork in comparison to the Pantanal population. Recent demographic expansion in the Pantanal was markedly evidenced by unimodal patterns of mismatch distribution and Fu’s Fs neutrality test in these three species. We hypothesize that the average time of population expansion (between 30,843 and 14,233 years before present) is associated to responses of these birds’ populations to paleoclimatic changes in these wetlands during the last glaciation period. We recommend special conservation efforts with the Jabiru Stork populations, a genetic monitoring program based on mtDNA, and an ecological characterization of these waterbirds species throughout their distribution range.
  • Genetic variability of Conopophaga lineata (Conopophagidae) (Wied-Neuwied, 1831) in Atlantic Forest fragments

    Dantas, GPM.; Santos, FR.; Marini, MA.

    Abstract in Portuguese:

    A fragmentação florestal afeta populações de aves de muitas maneiras, modificando a composição das comunidades e favorecendo espécies de áreas abertas. A Mata Atlântica é considerada um dos biomas mais importantes do mundo, devido à sua grande biodiversidade, aos altos níveis endemismo e de desmatamento. Apesar destas características, poucos estudos avaliaram os efeitos da fragmentação florestal na estrutura genética de populações de aves desse ecossistema. Dessa forma, este estudo visa verificar os efeitos da fragmentação florestal na variabilidade genética de Conopophaga lineata, através de marcadores RAPD. Assim, foram capturados 89 indivíduos de C. lineata em nove fragmentos florestais da Mata Atlântica do Estado de Minas Gerais. Os dados de RAPD indicam que a fragmentação florestal não afetou a variabilidade genética de Conopophaga lineata (Mann-Whitney U = 3,50; p = 0,11). Grande parte da variabilidade dessa espécie se encontra dentro das populações e não foi observada correlação entre a distância geográfica e a distância genética (Teste de Mantel t = 0,6250; p = 0.73). A análise UPGMA não mostrou clados definidos e todos os ramos apresentaram baixo suporte estatístico. A reduzida diferenciação populacional observada nessa espécie pode ser devida a intenso fluxo gênico entre as populações ou à recente fragmentação na região. Assim, a situação atual das populações de C. lineata indica que essa espécie não é significativamente afetada pela fragmentação. Entretanto, futuros estudos genéticos são essenciais para melhorar as estratégias de conservação da avifauna da Mata Atlântica do Brasil.

    Abstract in English:

    Forest fragmentation affects bird populations in many ways, modifying the composition of communities and favouring open country species. The Atlantic Forest is considered one of the most important biomes in the world, due to its great biodiversity, accelerated rates of deforestation, and high endemism. Despite these characteristics, few studies have evaluated the effects of forest fragmentation in the genetic structure of Atlantic forest bird populations. So, this study aims to verify the effects of forest fragmentation in the genetic population structure of Conopophaga lineata, through RAPD markers. To achieve this goal, 89 C. lineata individuals were captured in nine Atlantic Forest fragments in Minas Gerais State. The RAPD data indicate that forest fragmentation has not affected the genetic variation of C. lineata populations (Mann-Whitney U = 3.50; p = 0.11). Great part of the genetic variability of this species is found within populations and it was not observed a correlation between genetic and geographic distance (Mantel test t = 0.6250; p = 073). UPGMA analyses did not show defined clades and all branches showed low statistical support. The low population differentiation observed in this species can be due to a high gene flow among populations or a recent fragmentation. Thus, the current diversity status of C. lineata populations indicates that this species is not significantly affected by fragmentation. However, more genetic studies are essential to improve conservation strategies of Brazilian Atlantic Forest birds.
  • Population structuring of the endemic black-cheeked gnateater, Conopophaga melanops melanops (Vieillot, 1818) (Aves, Conopophagidae), in the Brazilian Atlantic Forest

    Lunardi, VO.; Francisco, MR.; Galetti Jr., PM.

    Abstract in Portuguese:

    Marcadores polimórficos de DNA amplificados ao acaso (RAPD) foram utilizados para analisar a diferenciação genética entre três populações do endêmico cuspidor-de-máscara preta (Conopophaga melanops melanops) de um amplo remanescente preservado da floresta Atlântica brasileira. Análises de Variância Molecular (AMOVA) (fiST = 0,13149, P < 0,0001) e o teste não paramétrico para a homogeneidade da variância molecular (HOMOVA) (B = 0,32337; P = 0,0019) comprovaram uma divergência genética significativa entre as três populações em um transecto contínuo de 250 km. Algumas explicações hipotéticas para estes resultados são a natureza sedentária da espécie e o isolamento histórico das populações em refúgios durante o Pleistoceno. Os presentes resultados sugerem que as populações locais foram diferenciadas naturalmente ao longo da distribuição original antes do recente processo de intenso desmatamento.

    Abstract in English:

    Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) markers were used to analyze genetic differentiation among three populations of the endemic Black-cheeked Gnateater (Conopophaga melanops melanops) within a larger pristine reminiscent of the Brazilian Atlantic Forest. Analyses of molecular variance (AMOVA) (phiST = 0.13149, P < 0.0001) and the nonparametric test for homogeneity of the molecular variance (HOMOVA) (B = 0.32337; P = 0.0019) showed a statistically significant genetic divergence among the three Black-cheeked Gnateater populations in a continuous transect of 250 km. Some hypothetic explanations for these results are the sedentary nature of the species and the historical isolation of the populations in refuges during the Pleistocene. The present results suggest that the local populations were naturally differentiated along the entire original range before the recent process of massive deforestation.
  • Mitochondrial DNA corroborates the species distinctiveness of the Planalto (Thamnophilus pelzelni Hellmayr, 1924) and the Sooretama (T. ambiguus Swainson, 1825) Slaty-antshrikes (Passeriformes: Thamnophilidae)

    Lacerda, DR.; Marini, MA.; Santos, FR.

    Abstract in Portuguese:

    O complexo Thamnophilus punctatus foi recentemente revisado, com base em caracteres morfológicos e vocais, sendo dividido em seis diferentes espécies. Duas dessas novas espécies, embora bem definidas com base em distinções morfológicas, não puderam ser definitivamente diferenciadas por seus cantos. Thamnophilus pelzelni (choca-do-planalto) e T. ambiguus (choca-de-sooretama) são mais facilmente diferenciadas por sutis e localizadas mudanças de coloração da plumagem de machos e fêmeas. Neste estudo, foram utilizadas seqüências de DNA mitocondrial (região controle, Citocromo b e ND2) a fim de avaliar os níveis de diferenciação molecular entre estas duas espécies. A divergência genética média entre as duas espécies foi de 3,8%, enquanto para cada região mitocondrial esta variou entre 2,7% e 4,9%. Embora tenha sido observada grande variabilidade entre haplótipos dentro das espécies, especialmente para T. ambiguus, os resultados sugerem que a divergência genética observada entre T. ambiguus e T. pelzelni é suficientemente elevada para corroborar o status de espécies separadas destes dois Thamnophilidae.

    Abstract in English:

    The Thamnophilus punctatus complex has been recently reviewed on the basis of morphological and vocal characters, and is divided in six different species. Two of the new species, although well defined on the basis of morphological differences, could not be unambiguously distinguished through their loudsongs. The Planalto Slaty-antshrike (Thamnophilus pelzelni) and the Sooretama Slaty-antshrike (T. ambiguus) are most easily distinguished by subtle and localized changes in plumage colors of males and females. In the present study we used sequences of the control region, Cytochrome b, and ND2 genes, of the mitochondrial DNA (mtDNA) to evaluate the levels of molecular differentiation between these two species. The mean pairwise distance between the two species was 3.8%, while it varied from 2.7% to 4.9% for each mtDNA region. Although extensive variation was also detected among haplotypes within species, especially for T. ambiguus, we suggest that the genetic divergence found between T. ambiguus and T. pelzelni is high enough to corroborate the separate species status of these two antbird taxa.
  • Genetic variability in three Amazon parrot species

    Lopes, IF.; Del Lama, MA.; Del Lama, SN.

    Abstract in Portuguese:

    Papagaios do gênero Amazona estão entre as espécies mais ameaçadas da Ordem Psittaciformes. O presente trabalho descreve polimorfismos enzimáticos em três espécies de papagaios do gênero Amazona: o papagaio verdadeiro (Amazona aestiva), o papagaio do mangue (Amazona amazonica) e o papa-cacau (Amazona festiva). Estes dados foram utilizados para avaliação da variabilidade genética dessas espécies. Foram analisadas, através de eletroforese, amostras de sangue de 68 indivíduos capturados na natureza e mantidos em cativeiro em três zoológicos brasileiros. Oito dentre dez locos enzimáticos analisados exibiram polimorfismo. O loco da Glicose Fosfato Isomerase (Gpi) demonstrou ser um loco diagnóstico para a identificação dessas espécies de papagaios. A heterozigosidade média esperada para A. aestiva (0,060) diferiu significativamente das heterozigosidades esperadas para A. amazonica e A. festiva (0,042 e 0,039, respectivamente). Este resultado foi discutido como uma conseqüência de hibridização entre duas subespécies geográficas de A. aestiva e, alternativamente, como uma característica particular da espécie. Comparada a aves em geral, a variabilidade genética de A. aestiva não é baixa, apesar deste papagaio ser uma das espécies mais comercializadas ilegalmente. A análise alozímica demonstrou ser uma ferramenta útil para o monitoramento da variabilidade genética do gênero Amazona, podendo ser aplicada em programas de manejo destas e de outras espécies ameaçadas pertencentes ao mesmo gênero.

    Abstract in English:

    Parrots of the genus Amazona are among the most threatened species of the Order Pscittaciformes. This work describes allozyme polymorphisms in three Amazon parrot species - the Blue-fronted Amazon (Amazona aestiva), the Orange-winged Amazon (Amazona amazonica), and the Festive Amazon (Amazona festiva) -, and provides useful data for the evaluation of their genetic variability. We electrophoretically analyzed blood samples from 68 wild-caught individuals, maintained in captivity in three Brazilian zoos. Eight of the ten studied enzyme loci exhibited polymorphism. Glucosephosphate isomerase (Gpi) proved to be a diagnostic locus for the identification of these Amazon species. The expected average heterozygosity of the Blue-fronted Amazon (0.060) differed significantly from the expected heterozygosities of the Orange-winged Amazon and the Festive Amazon (0.040 and 0.039, respectively). This result was discussed as a consequence of hybridization between two geographic A. aestiva subspecies, and alternatively as a particular trait of this species. Genetic variability of the Blue-fronted Amazon compared to birds in general is not low on a species-wide level, despite the fact that this parrot is one of the most illegally traded species. Allozyme analysis proved to be an useful tool in monitoring the genetic variation within the genus Amazona and can be applied in the management program of other threatened species of this genus.
  • Genetic evidence of population structuring in the neotropical freshwater fish Brycon hilarii (Valenciennes, 1850)

    Sanches, A; Galetti Jr, PM.

    Abstract in Portuguese:

    Brycon hilarii é uma espécie de peixe migrador, distribuída por toda a Bacia do Paraguai, bastante apreciada tanto pela qualidade da carne quanto para a pesca esportiva, além de ser a principal espécie de interesse turístico da região de Bonito (MS, Brasil). Considerando a ausência de informações sobre a estrutura genética dos peixes desta espécie, o presente trabalho visou detectar a variabilidade genética de Brycon hilarii através de marcadores RAPD. Foi estudado um total de 80 exemplares amostrados em diferentes períodos do ano, em 4 localidades da sub-bacia do Rio Miranda (Bacia do Rio Paraguai, Brasil). Os resultados de similaridade genética, de diversidade de Shanon e AMOVA evidenciaram diferenças entre as localidades amostradas. Através da AMOVA, a diferenciação populacional foi mais evidente entre os peixes coletados no período não-reprodutivo, que representa a época de menor deslocamento desses peixes. Desta forma, ao contrário da idéia até então aceita de que os peixes migradores de água doce formam grandes populações panmíticas em um dado sistema hidrográfico, sugere-se a ocorrência de um modelo de sub-estruturação populacional onde os indivíduos de B. hilarii se organizam em unidades reprodutivas geneticamente diferenciadas e mantêm sua integridade co-existindo e co-migrando através do sistema estudado. Apesar da falta de um cenário completo a respeito da distribuição de B. hilarii na região estudada, esta idéia inicial acerca de sua estrutura genético-populacional pode ser uma contribuição muito importante principalmente por fornecer subsídios para planos de manejo e conservação desses peixes.

    Abstract in English:

    Brycon hilarii is a migratory fish widely distributed throughout the Paraguay River Basin. It is appreciated in sport fishing and for its superior meat quality. It is also the main species for tourist attraction in the Bonito region (State of Mato Grosso do Sul, Brazil). Considering the lack of information on the genetic structure of the fish of this species, the aim of the present study was to detect the genetic variability of Brycon hilarii through RAPD markers. A total of eighty specimens collected in different seasons at four sites of the Miranda River sub-basin (Paraguay River Basin, Brazil) were used for analysis. The results of genetic similarity, Shannon diversity, and AMOVA revealed differences between the sampling sites. Through AMOVA, differences between populations were more evident among the animals collected during the non-reproductive season, corresponding to a time of less movement of these fish. A population structuring model in which B. hilarii appears organized into genetically differentiated reproductive units that coexist and co-migrate through the studied system was suggested, contrasting the currently accepted idea that freshwater migratory fish form large panmictic populations in a determined hydrographic system. Despite the lack of a complete picture regarding the distribution of B. hilarii in the studied region, this initial idea on its population genetic structure could be an important contribution to providing aid for management and conservation programs of these fish.
  • Evolutionary cytogenetics of the Hoplias lacerdae, Miranda Ribeiro, 1908 group: a particular pathway concerning the other Erythrinidae fish

    Morelli, S.; Vicari, MR.; Bertollo, LAC.

    Abstract in Portuguese:

    A taxonomia dos Erythrinidae encontra-se ainda por ser totalmente esclarecida, existindo várias dúvidas sobre suas relações filogenéticas. No presente estudo, foram analisados os cariótipos e características cromossômicas de algumas espécies do grupo Hoplias lacerdae (Erythrinidae), de diferentes bacias hidrográficas do Brasil e estações de piscicultura, empregando-se a coloração Giemsa convencional, bandamento C, coloração com nitrato de prata, fluorocromos Mitramicina e Distamicina/DAPI, e hibridação fluorescente in situ (FISH). O número diplóide de 2n = 50 cromossomos foi constante, sendo os cariótipos formados por cromossomos de dois braços, meta- e submetacêntricos, sem diferenciação relacionada ao sexo. Foi identificado apenas um sítio ativo de região organizadora de nucléolo (NOR), presente no par cromossômico no. 11, identificado tanto pela coloração com nitrato de prata (Ag-NOR) como por FISH com sonda de DNAr 45S, embora alguns sítios adicionais de DNAr tenham sido identificados em outros pares de cromossomos, apenas por FISH. O sítio de Ag-NOR no cromossomo 11 mostrou-se rico em pares de bases GC, sendo Mitramicina-positivo. Sítios Mitramicina-positivos/DAPI-negativos foram igualmente observados nas regiões centroméricas/pericentroméricas dos pares cromossômicos 4, 6, 15 e 19, os quais mostraram também afinidade pelo nitrato de prata. Contudo, estes quatro sítios não foram evidenciados por FISH com sonda de DNAr 45S, indicando serem somente regiões de heterocromatina GC-rica, com afinidade pela prata. Os dados cromossômicos mostram que a evolução cariotípica no grupo Hoplias lacerdae é relativamente conservada e segue um comportamento particular em relação aos outros eritrinídeos, como Hoplias malabaricus, Hoplerythrinus unitaeniatus e Erythrinus erythrinus, nos quais foram encontrados cariótipos politípicos. Assim sendo, o grupo H. lacerdae mostra características cromossômicas discordantes daquelas evidenciadas pelo grupo congenérico H. malabaricus. Estes dados, juntamente com os outros dados genéticos e morfológicos, constituem ferramentas importantes a serem consideradas em uma revisão ampla da família Erythrinidae, assim como para programas de conservação.

    Abstract in English:

    The taxonomy/systematics of the Erythrinidae fish is still imprecise, with several doubts on their relationships. Karyotypes and chromosomal characteristics of some species of the Hoplias lacerdae group (Erythrinidae), from different Brazilian hydrographic basins and pisciculture stations, were analyzed in the present study, using conventional Giemsa staining, C-banding, silver staining, Mithramycin and Distamycin/DAPI fluorochromes, and fluorescent in situ hybridization (FISH). A diploid chromosome number of 2n = 50 and karyotypes composed of meta- and submetacentric chromosomes without sex-related differences were found. Only one active NOR (Nucleolar Organizer Region) site was found, which was identified by silver staining (Ag-NOR) and FISH, located on the chromosome pair 11, although additional 45S rDNA sites were also mapped on other chromosome pairs only by FISH. The Ag-NOR of the chromosome pair 11 was found to be GC-rich, appearing positive after Mithramycin staining. Mithramycin-positive/DAPI-negative sites were also observed in the centromeric/pericentomeric regions of the chromosome pairs 4, 6, 15, and 19, which have also affinity to silver nitrate. However, these four sites were not detected by FISH with the rDNA probe, indicating to be only argentophilic GC-rich heterochromatic regions. Chromosome data show that the karyotype evolution in Hoplias lacerdae group is relatively conserved and follows a particular pathway concerning the other Erythrinidae fishes, such as Hoplias malabaricus, Hoplerythrinus unitaeniatus, and Erythrinus erythrinus, in which polytypic karyotypes are found. Thus, the H. lacerdae group shows chromosome features that are not closely related to those of the congeneric H. malabaricus group. These finds, together with genetic and morphologic data, are important tools to be considered in a major revision of the Erythrinidae family, as well as for conservation programs.
  • Occurrence of B chromosomes in Cyphocharax modestus (Fernández-Yépez, 1948) and Steindachnerina insculpta (Fernández-Yépez, 1948)(Characiformes, Curimatidae) from the Tibagi River basin (Paraná State, Brazil)

    Gravena, W.; Teribele, R.; Giuliano-Caetano, L.; Dias, AL.

    Abstract in Portuguese:

    Foram analisados, citogeneticamente, 18 indivíduos de Cyphocharax modestus e 41 indivíduos de Steindachnerina insculpta da bacia do rio Tibagi (Paraná, Brasil). Todos os espécimes apresentaram 2n = 54 cromossomos, todos do tipo meta-submetacêntrico (M-SM). A presença de 1 ou 2 cromossomos B foi detectada em alguns indivíduos de C. modestus de duas populações amostradas, evidenciando uma variação inter e intraindividual. Em S. insculpta, também foram observados cromossomos B, embora em somente uma população, mostrando também uma variação inter e intraindividual. Bandamento C foi usado para mostrar que os cromossomos B identificados apresentaram-se totalmente heterocromáticos nas duas espécies examinadas.

    Abstract in English:

    We cytogenetically analyzed 18 individuals of Cyphocharax modestus, and 41 individuals of Steindachnerina insculpta from the Tibagi River basin (Paraná State, Brazil). All the specimens had 2n = 54 chromosomes, all meta-submetacentric (M-SM). The presence of 1 or 2 B chromosomes was seen in some individuals of C. modestus of the two sampled populations, showing inter- and intra individual variation. In S. insculpta, B chromosomes were also observed but only in one population, also showing inter- and intra individual variation. C-banding was used to show that the identified B chromosomes were totally heterochromatic in the two examined species.
  • Conservation strategies for Arapaima gigas (Schinz, 1822) and the Amazonian várzea ecosystem

    Hrbek, T.; Crossa, M.; Farias, IP.

    Abstract in Portuguese:

    No presente estudo, é descrita uma análise de autocorrelação espacial de dados moleculares obtidos para Arapaima gigas e a implicação deste estudo para sua conservação e manejo. Arapaima é uma espécie de peixe gigante da várzea Amazônica de grande importância econômica, e criticamente sobre-explorada. A análise de 14 locos microssatélites e de 2.347 pb do DNAmt de 126 indivíduos amostrados em sete localidades na bacia Amazônica sugere que Arapaima forma uma população contínua com grande fluxo genético entre localidades. Um pequeno efeito de isolamento por distância é observado através dos dados de microssatélites, mas não através dos dados de DNAmt. A análise de autocorrelação espacial de dados genéticos e geográficos sugere que o fluxo gênico é significativamente restrito em distâncias maiores que 2.500 km. É recomendada a implementação de um modelo de manejo e conservação de metapopulação no padrão doador-receptor, replicando as reservas de várzea na bacia Amazônica superior, central e inferior. Esta estratégia de conservação iria: 1) preservar toda a atual diversidade genética da Arapaima; 2) criar um conjunto de reservas para fornecer imigrantes para populações locais reduzidas; 3) preservar áreas centrais de várzea na bacia Amazônica das quais diversas outras espécies dependem. Estratégias de conservação não deveriam somente preservar a atual diversidade genética, mas também os processos evolutivos que têm gerado os padrões observados.

    Abstract in English:

    In the present study we report a spatial autocorrelation analysis of molecular data obtained for Arapaima gigas, and the implication of this study for conservation and management. Arapaima is an important, but critically over-exploited giant food fish of the Amazonian várzea. Analysis of 14 variable microsatellite loci and 2,347 bp of mtDNA from 126 individuals sampled in seven localities within the Amazon basin suggests that Arapaima forms a continuous population with extensive genetic exchange among localities. Weak effect of isolation-by-distance is observed in microsatellite data, but not in mtDNA data. Spatial autocorrelation analysis of genetic and geographic data suggests that genetic exchange is significantly restricted at distances greater than 2,500 km. We recommend implementing a source-sink metapopulation management and conservation model by proposing replicate high quality várzea reserves in the upper, central, and lower Amazon basin. This conservation strategy would: 1) preserve all of the current genetic diversity of Arapaima; 2) create a set of reserves to supply immigrants for locally depleted populations; 3) preserve core várzea areas in the Amazon basin on which many other species depend. We stress that conservation strategies should not only preserve current genetic diversity, but also the evolutionary processes which have generated the observed patterns.
  • Population analysis of Scomberomorus cavalla (Cuvier, 1829) (Perciformes, Scombridae) from the Northern and Northeastern coast of Brazil

    Santa Brígida, EL.; Cunha, DB.; Rego, PS.; Sampaio, I.; Schneider, H.; Vallinoto, M.

    Abstract in Portuguese:

    Scomberomorus cavalla é uma espécie de peixe pelágico amplamente distribuído na costa oeste do Atlântico, e uma diminuição no seu nível de captura tem sido verificada nos E.U.A e Golfo do México, comparada com os níveis alcançados pela espécie no passado. Da mesma forma, em algumas áreas do Brasil, há indícios de sobre-exploração. Entretanto, não existem estudos moleculares que visam o manejo deste importante item. Desta forma, no presente estudo, foram seqüenciados 380 pares de bases nucleotídicas da região da Alça-D do DNA mitocondrial de amostras provenientes de desembarque em Macapá, Bragança e Fortaleza. As análises filogenéticas e populacionais revelaram que há apenas uma população panmítica e baixos níveis de variabilidade genética foram observados. Estes resultados, assim como a observada sobre-exploração de S. cavala, representam dados muito importantes para o estabelecimento do manejo deste estoque a fim de prevenir um colapso ou risco de extinção no futuro.

    Abstract in English:

    Scomberomorus cavalla is a pelagic fish species widely distributed on the Atlantic west coast, and a noticeable decrease in its capture level in the USA and Gulf of Mexico is occurring, compared to the levels reached by the species in the past. Likewise, in some areas of Brazil, there has been indication of over-harvesting. However, there are no molecular studies focusing on the management of such an important item. Thus, in the present study, 380 nucleotide base pairs of the mitochondrial DNA D-Loop region of samples from Macapá, Bragança, and Fortaleza were sequenced. Phylogenetic and population analyses revealed that there is only one panmitic population, and low levels of genetic variability were verified. These results, as well as the noticed over-harvesting of S. cavalla, represent very important data to determine the management of such stock in order to prevent a collapse or the risk of future extinction.
  • Genetic diversity of three ornamental reef fishes (Families Pomacanthidae and Chaetodontidae) from the Brazilian coast

    Affonso, PRAM.; Galetti Jr., PM.

    Abstract in Portuguese:

    Os peixes recifais das famílias Pomacanthidae (peixes-anjo) e Chaetodontidae (peixes-borboleta) são espécies ornamentais populares, intensivamente coletadas para o comércio aquariófilo. Os impactos dessa atividade na diversidade intra-específica e no ecossistema recifal ainda são pouco conhecidos no Atlântico Sul. No presente trabalho, uma análise genética em fina escala usando marcadores RAPD foi realizada em diferentes amostras de Holacanthus ciliaris (anjo ciliaris), Pomacanthus paru (peixe frade) e Chaetodon striatus (borboleta striatus) ao longo da costa brasileira. A maior parte da variação genética nas três espécies relacionou-se à diversidade intrapopulacional. Contudo, resultados da AMOVA demonstraram que H. ciliaris apresenta uma estruturação populacional sutil (sigmast = 0,132, P = 0,003), enquanto P. paru e C. striatus apresentam uma baixa diferenciação genética, particularmente reduzida na última (sigmast = 0,090, P = 0,001 e sigmast = 0,041, P = 0,028, respectivamente). O fluxo gênico (Nm) também foi mais alto em C. striatus do que nas espécies de Pomacanthidae. Os padrões de diferenciação genética registrados contrastam com o estágio pelágico inicial similar nas espécies selecionadas, sugerindo que a dispersão larval per se não é um bom indicador de estrutura populacional nesses peixes recifais. Fatores ecológicos associados à história biogeográfica e distintas pressões seletivas locais podem desempenhar um papel fundamental na composição genética de cada espécie. Embora preliminares, os resultados apresentados fornecem subsídios para o monitoramento da variabilidade genética dessas espécies recifais. Tais diferenças na estrutura genética entre espécies co-existentes devem ser consideradas para a conservação de eventuais unidades evolutivas dentro da Província Brasileira.

    Abstract in English:

    Reef fishes of the families Pomacanthidae (angelfish) and Chaetodontidae (butterflyfish) are popular ornamental species, intensively harvested for the aquarium trade. The impacts of such activity on intra-specific diversity and reef ecosystems are still poorly understood in the south Atlantic. In the present work, a fine-scale genetic analysis using RAPD markers was performed in distinct samples of the queen angelfish (Holacanthus ciliaris), French angelfish (Pomacanthus paru), and banded butterflyfish (Chaetodon striatus) along the Brazilian coast. Most of the genetic variation in the three species was related to intra-population diversity. However, AMOVA results demonstrated that H. ciliaris presents a subtle population structure (sigmast = 0.132, P = 0.003), while P. paru and C. striatus present low genetic differentiation, especially remarkable in the latter (sigmast = 0.090, P = 0.001 and sigmast = 0.041, P = 0.028, respectively). Gene flow (Nm) was also higher in C. striatus than in the angelfish species. The reported patterns of genetic differentiation contrast with the similar pelagic stage of the selected species, suggesting that larval dispersal per se is a poor predictor of population structure in these reef fishes. Ecological features coupled with biogeographic history and distinct local selective pressures might play a major role on the genetic composition of each species. Although preliminary, the present results provide a baseline for monitoring the genetic variability in these reef species. These differences in the genetic structure among co-occurring species should be taken into consideration for the conservation of eventual evolutionary units along the Brazilian Province.
  • Structural chromosome polymorphism in a Pimelodus maculatus La Cepède, 1803 population (Siluriformes, Pimelodidae) from the Paranapanema River basin, PR, Brazil

    Mazzuchelli, J.; Swarça, AC.; Dias, AL.

    Abstract in Portuguese:

    No presente estudo citogenético, foram analisados, mediante coloração convencional, 13 exemplares de Pimelodus maculatus, (8 machos e 5 fêmeas), do ribeirão Congonhas, PR, Brasil. Todos apresentaram um cariótipo com 2n = 56, distribuídos em 20 cromossomos metacêntricos (m), 20 submetacêntricos (sm), 10 subtelocêntricos (st) e 6 acrocêntricos (a). Entretanto, 4 indivíduos (2 machos e 2 fêmeas) apresentaram um cariótipo variante (citótipo) com dois cromossomos heteromórficos no grupo dos submetacêntricos, sendo um deles o segundo maior deste grupo e o outro de tamanho pequeno. Esta variação sugere a ocorrência de um polimorfismo estrutural na população estudada.

    Abstract in English:

    In the present cytogenetic study of Pimelodus maculatus, 13 specimens (8 males and 5 females) from the Congonhas Stream in Paraná State, Brazil, were examined using conventional staining. All of them showed a karyotype of 2n = 56, with a chromosome distribution of 20m + 20sm + 10st + 6a. However, four individuals (2 males and 2 females) were found to have a variant karyotype (cytotype) with two heteromorphic chromosomes in the group of submetacentric chromosomes - one of them corresponds to the second largest chromosome of this group and the other is a chromosome of small size. This variation suggests the existence of a structural polymorphism in the studied population.
  • Genetic diversity within and between broodstocks of the white shrimp Litopenaeus vannamei (Boone, 1931) (Decapoda, Penaeidae) and its implication for the gene pool conservation

    Freitas, PD.; Calgaro, MR.; Galetti Jr., PM.

    Abstract in Portuguese:

    A variação genética existente dentro e entre quinze linhagens fechadas de reprodutores do camarão branco Litopenaeus vannamei, mantidas em diferentes laboratórios de larvicultura na costa brasileira, foi estudada utilizando análises RAPD. Através de um conjunto de cinco iniciadores decâmeros em PCR, foram identificados 52 locos polimórficos. A análise da diversidade genética dentro de cada linhagem evidenciou perda da variação genética provavelmente devida a efeitos de bottleneck e endocruzamento. Em adição, os valores de divergência genética entre as diferentes linhagens parecem refletir a composição inicial de fundação desses estoques, em alguns casos, compartilhando uma origem comum, sugerindo uma importância potencial do exo-cruzamento para estabelecer programas de melhoramento genético baseado nessas linhagens reprodutoras. O monitoramento da variação genética será muito útil para a conservação do conjunto gênico desta espécie de aquacultura, especialmente se for considerado seu status exótico no Brasil e que atualmente é impossível a realização de novas introduções de indivíduos selvagens.

    Abstract in English:

    Genetic variation within and between fifteen closed broodstock lines of the Pacific white shrimp Litopenaeus vannamei, reared at different hatcheries in the Brazilian coast, was assessed by RAPD analysis. Fifty two polymorphic loci were identified when a set of five decamer primers was used in PCR. The genetic diversity analysis within lines evidenced genetic variation loss probably related to bottleneck effects and inbreeding. In addition, the genetic divergence values between the different samples appear to reflect the initial founder composition of such stocks, in some cases, sharing a common origin, suggesting a putative importance of interbreeding for the establishment of genetic improvement programs for these broodstocks. The genetic variation monitoring appears to be helpful to the gene pool conservation of this aquaculture species, mainly if considered its exotic status in Brazil and the current impossibility of new introduction of wild individuals.
  • Comparative cytogenetic study in Muscidae flies

    Parise-Maltempi, PP.; Avancini, RMP.

    Abstract in Portuguese:

    O número modal de cromossomos dos Dípteros Muscóideos é 2n = 12, incluindo cinco pares de autossomos e um par de cromossomos sexuais. No entanto, algumas espécies com 2n = 10 cromossomos já foram descritas, sendo todas pertencentes à família Muscidae. No presente trabalho, foram analisados os cariótipos de algumas espécies de Muscidae de diferentes subfamílias e os dados obtidos foram comparados com os cariótipos de algumas espécies das famílias Calliphoridae e Sarcophagidae. Comparações destas espécies com outras da família Muscidae revelaram uma considerável variação entre seus cromossomos sexuais. Esta variação no tamanho dos cromossomos sexuais sugere que parte destes cromossomos foram perdidos ou sofreram fusão com autossomos. As regiões de heterocromatina constitutiva e as regiões organizadoras de nucléolos (RONs) foram também analisadas e alguns aspectos sobre a relação destas com os cromossomos sexuais são discutidos.

    Abstract in English:

    The chromosome modal number in Muscoidea Diptera is 2n = 12, including five pairs of autosomes and one sex chromosome pair. Nevertheless, some species with 2n = 10 chromosomes have been described, all of them from the Muscidae family. We analyzed the karyotype of some Muscidae species from different subfamilies and compared the obtained data with the karyotypes of some species of the families Calliphoridae and Sarcophagidae. Comparisons of these species with other Muscidae species revealed a considerable variation among their sex chromosomes. This variation in the length of the sex chromosomes suggests that parts of these chromosomes were lost or fused with autosomes. The constitutive heterochromatic regions and the nucleolar organizer regions (NORs) were also analyzed and some aspects about the relationship between these regions and the sex chromosomes are discussed.
  • Chromosome polymorphism and complements in populations of Girardia species (Platyhelminthes, Tricladida, Paludicola) from southern Brazil

    Benya, E.; Leal-Zanchet, AM.; Santos, WH.; Hauser, J.; Erdtmann, B.

    Abstract in Portuguese:

    Os cariótipos de quatro espécies de planárias de água doce do gênero Girardia (Platyhelminthes), a saber, G. schubarti, G. tigrina, G. anderlani e G. biapertura, de populações ocorrentes em diferentes locais do estado do Rio Grande do Sul, na região sul do Brasil, foram analisados. O cariótipo de G. biapertura é apresentado pela primeira vez. Foram observados três complementos básicos, de 4, 8 e 9 cromossomos. Espécimes diplóides, triplóides e mixoplóides (2n/3n) foram observados freqüentemente nessas populações. O complemento cromossômico básico de n = 9 foi verificado em duas espécies (G. biapertura e G. anderlani), apresentando um grande cromossomo acrocêntrico que é raro na família Dugesiidae. Também foi observada certa variabilidade cromossômica, tanto intra- como interespecífica, cujas implicações evolutivas são discutidas.

    Abstract in English:

    The karyotypes of four species of freshwater triclads of the genus Girardia (Platyhelminthes), i.e. G. schubarti, G. tigrina, G. anderlani, and G. biapertura, from populations of different localities of the Rio Grande do Sul State, in southern Brazil, were analyzed. The karyotype of G. biapertura is presented for the first time. Three basic complements of 4, 8, and 9 chromosomes were found. Diploids, triploids, or mixoploids (2n/3n) specimens were frequently detected in these populations. The basic chromosomal complement of n = 9 was verified in two different species (G. biapertura and G. anderlani), presenting a large acrocentric chromosome which is rare in the family Dugesiidae. An intra and interspecific chromosomal variability was also detected and its evolutionary implications are discussed.
  • Intra and inter populational genetic variability in Maytenus ilicifolia Mart. ex Reiss. 1861, through RAPD markers

    Mossi, AJ.; Cansian, RL.; Leontiev-Orlov, O.; Zanin, EM.; Oliveira, CH.; Cechet, ML.; Carvalho, AZ.; Echeverrigaray, S.

    Abstract in Portuguese:

    Maytenus ilicifolia é uma planta medicinal bastante utilizada na medicina popular da região sul do Brasil. O objetivo deste estudo foi quantificar a variabilidade genética intra e interpopulacional em três populações de M. ilicifolia visando a conservação genética desta espécie, que se encontra ameaçada pela ação antrópica. Marcadores RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) foram utilizados para analisar 30 plantas de cada uma das três populações coletadas na região do Alto Uruguai Gaúcho. Foram selecionados 14 primers, que geraram 158 bandas, das quais 71,5% foram polimórficas. A comparação das distâncias de Jaccard mostraram que a variabilidade intra populacional foi maior que a interpopulacional, e a análise de agrupamentos permitiu a separação das três populações. Somente 7.6% das bandas foram específicas de pelo menos duas populações. Os resultados indicam que as populações de M. ilicifolia analisadas representam um único conjunto gênico, de tal forma que qualquer uma das populações pode representar a variabilidade genética geral da espécie na região.

    Abstract in English:

    Maytenus ilicifolia is a medicinal plant largely used in the South Brazilian folk medicine. The aim of this study was to quantify the intra and inter populational genetic variability in three populations of M. ilicifolia, focusing on the genetic conservation of this species, which has been threatened by anthropic action. RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) markers were used to analyze 30 plants of each of the three populations collected in the Alto Uruguai Gaúcho region. Fourteen selected primers generated a total of 158 bands, 71.5% of which were polymorphic. The comparison of Jaccard’s distances showed that the intra populational variation was higher than the inter populational variability, and cluster analysis allowed the separation of the three populations. Just 7.6% of the bands were specific of at least two populations. Data indicate that the analyzed M. ilicifolia populations represent a single genetic pool, and therefore any of the population thoroughly can represent the overall genetic variability of the species in the sampled region.
  • Identification of pumas (Puma concolor (Linnaeus, 1771)) through faeces: a comparison between morphological and molecular methods Notes And Comments

    Miotto, RA.; Ciocheti, G.; Rodrigues, FP.; Galetti Jr., PM.
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