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Genetics and Molecular Biology, Volume: 21, Issue: 4, Published: 1998
  • Origin of the hemoglobin S gene in a northern Brazilian population: the combined effects of slave trade and internal migrations Human And Medical Genetics

    Pante-de-Sousa, Gabriella; Mousinho-Ribeiro, Rita de Cassia; Santos, Eduardo José Melo dos; Zago, Marco Antonio; Guerreiro, João Farias

    Abstract in Portuguese:

    Com o objetivo de investigar a origem da mutação <FONT FACE="Symbol">b</font>S na população da região norte do Brasil, foram analisados polimorfismos de DNA no complexo de genes <FONT FACE="Symbol">b</font> da hemoglobina em 30 pacientes com anemia falciforme na população de Belém, a capital do Estado do Pará. Sessenta e sete por cento dos cromossomos <FONT FACE="Symbol">b</font>S analisados apresentaram o haplótipo Bantu, 30% o haplótipo Benin e 3% o haplótipo Senegal. A origem da mutação<FONT FACE="Symbol"> b</font>S na população de Belém, estimada de acordo com a distribuição de haplótipos, não está de acordo com a esperada com base em dados históricos sobre o tráfico de escravos para a região norte, os quais indicam uma reduzida contribuição de escravos da região do Benin. Essas diferenças podem ser atribuídas ao tráfico interno de escravos, bem como ao posterior fluxo de populações imigrantes, particularmente de nordestinos. A distribuição de haplótipos em Belém não difere significativamente da observada em outras regiões brasileiras, muito embora os dados históricos sugiram que a maioria dos escravos procedentes da região do Atlântico-Oeste africano, onde predomina o haplótipo Senegal, foi trazida para o norte do Brasil, enquanto que o nordeste (Bahia, Pernambuco e Maranhão) recebeu o maior contingente de escravos oriundos da região centro-oeste africana, onde o haplótipo Benin é o mais comum. Nós sugerimos que as diferenças regionais quanto à procedência dos escravos africanos também foram modificadas pelo tráfico de escravos estabelecido entre as diferentes regiões brasileiras e posteriormente pelos movimentos migratórios.

    Abstract in English:

    We analyzed DNA polymorphisms in the <FONT FACE="Symbol">b</font>-globin gene cluster of 30 sickle cell anemia patients from Belém, the capital city of the State of Pará, in order to investigate the origin of the <FONT FACE="Symbol">b</font>S mutation. Sixty-seven percent of the <FONT FACE="Symbol">b</font>S chromosomes were Bantu type, 30% were Benin type, and 3% were Senegal type. The origin of the <FONT FACE="Symbol">b</font>S mutation in this population, estimated on the basis of <FONT FACE="Symbol">b</font>S-linked haplotypes, contradicts the historical records of direct slave trade from Africa to the northern region of Brazil. Historical records indicate a lower percentage of people from Benin. These discrepancies are probably due to domestic slave trade and later internal migrations, mainly from northeastern to northern regions. Haplotype distribution in Belém did not differ significantly from that observed in other Brazilian regions, although historical records indicate that most slaves from Atlantic West Africa, where the Senegal haplotype is prevalent, were destined for the northern region, whereas the northeast (Bahia, Pernambuco and Maranhão) was heavily supplied with slaves from Central West Africa, where the Benin haplotype predominates.
  • Mild clinical expression of S-<FONT FACE=Symbol>b</font> thalassemia in a Brazilian patient with the <FONT FACE=Symbol>b</font>+ IVS-I-6 (T<FONT FACE=Symbol>®</font>C) mutation Human And Medical Genetics

    Sonati, Maria de Fátima; Kaeda, Jaspal; Kimura, Elza Miyuki; Costa, Fernando Ferreira; Luzzatto, Lucio

    Abstract in Portuguese:

    Nós caracterizamos a base molecular da talassemia b em uma paciente negra brasileira, de 8 anos de idade, com um quadro clínico extremamente benigno de S-b+ talassemia. A paciente tinha uma hemoglobina total de 10,1 g/dl, com 57% de HbS. O sequenciamento direto do DNA, amplificado por PCR, revelou que a paciente é heterozigota da mutação b+ IVS-I-6 (T®C). Esta mutação, algumas vezes referida como o tipo português de talassemia, foi encontrada em associação com o polimorfismo C®T no codon 2 do gene b e, de nosso conhecimento, não havia sido previamente descrita na população negra brasileira.

    Abstract in English:

    We report on an eight-year-old Brazilian girl with S-b+ thalassemia. The patient had a steady 10.1 g/dl hemoglobin with 57% HbS. Direct sequence analysis of b-globin gene showed her to be heterozygous for the IVS-I-6 (T®C) mutation. This b+ thalassemia mutation, sometimes referred to as the Portuguese type, was found to be associated with the C®T polymorphism at codon 2. In combination with the bS gene, this mutation results in very mild sickle cell disease symptoms.
  • Beta-globin gene cluster haplotypes in the Mapuche Indians of Argentina Human And Medical Genetics

    Kaufman, Letícia; Carnese, Francisco R.; Goicoechea, Alicia; Dejean, Cristina; Salzano, Francisco M.; Hutz, Mara H.

    Abstract in Portuguese:

    Haplótipos derivados de cinco sítios de restrição polimórficos presentes no agrupamento da globina beta foram investigados em 86 cromossomos da população mapuche da Argentina. Esses resultados foram analisados em conjunto com os previamente obtidos para dez tribos indígenas brasileiras. Oito haplótipos foram identificados, dos quais os mais freqüentes foram o 2 (57%) e o 6 (27%). A presença do haplótipo 3 em 2% dos cromossomos dos Mapuches é uma evidência de mistura com indivíduos de ancestralidade africana. Devido ao alto número de haplótipos, a heterozigosidade medida pelo índice Gini-Simpson é mais alta nos Mapuches do que nos índios brasileiros. A distribuição haplotípica nos Mapuches é também significativamente diferente da observada nas tribos brasileiras. Essa heterogeneidade poderia ser parcialmente explicada pela mistura com populações não-indígenas.

    Abstract in English:

    Haplotypes derived from five polymorphic restriction sites in the beta-globin gene cluster were investigated in 86 chromosomes from the Argentinian Mapuche. These results were integrated with those previously obtained for ten Brazilian Indian tribes. Eight haplotypes were identified, the most frequent being 2 (57%) and 6 (27%). The presence of haplotype 3 in 2% of the Mapuche chromosomes is probably an evidence of admixture with individuals of African ancestry. Due to the high number of haplotypes observed, heterozygosity as measured by the Gini-Simpson index was higher in the Mapuche than in Brazilian Indians. The haplotypic distribution in the Mapuche was also significantly different from those of all Brazilian tribes investigated. This heterogeneity could be at least partially explained by admixture with non-Indian populations.
  • Interaction between ABO and haptoglobin systems in a Chilean population of mixed ancestry Human And Medical Genetics

    Acuña, M.; Eaton, L.

    Abstract in Portuguese:

    Para investigar a associação entre os grupos sanguíneos ABO e a haptoglobina sérica (Hp), nós tipamos Hp e os grupos ABO em 288 crianças, que foram selecionadas ao acaso dentre aquelas que começaram o primeiro grau escolar em 1973 na área metropolitana norte de Santiago, Chile. Esta região tem um componente ameríndio de 40% e um componente caucasiano (principalmente espanhóis) de 60%. Nossos resultados contrastam com estudos prévios que relataram que Hp*1 variou entre os grupos ABO da seguinte maneira: O < A < B < AB, e onde Hp*1 foi significativamente menor em indivíduos do grupo O. No presente estudo, a ordem foi A < O » B < AB. Nós encontramos mais indivíduos A e menos O com alelo Hp*2 e genótipo Hp 2-2, além de mais Hp*1 entre os indivíduos do grupo O.

    Abstract in English:

    In order to investigate the association between ABO blood groups and serum haptoglobin (Hp), we typed Hp and ABO blood groups in 288 children, who were selected at random among those who began their primary school in 1973 in the Northern Metropolitan area of Santiago, Chile. This region has an Amerindian component of 40% and a Caucasian component (principally Spanish) of 60%. Our results are in contrast with previous studies which have reported that Hp*1 varied among ABO groups in the following manner, O < A < B < AB, and where Hp*1 was significantly lower in group O individuals. In the present study, the order was A < O » B < AB. We found more A and less O individuals with allele Hp*2 and genotype Hp 2-2, and more Hp*1 among O individuals.
  • Early infantile form of galactosialidosis in a female baby with a prenatal diagnosis of fetal ascites: First case in Brazil Human And Medical Genetics

    Santos, Cláudia Maria Carvalho dos; Correia, Patrícia Santana; Rosa, Antônio Abílio Santa; Vaniazzi, Elde; Coelho, Janice Carneiro; Burin, Maira Graeff; Giugliani, Roberto; Fensom, Anthony H.; Oliveira, Cesário Paulo Honório de; Oliveira, Maria Lúcia Costa de; Llerena Jr., Juan Clinton

    Abstract in Portuguese:

    Apresentamos o primeiro caso de galactosialidose do tipo infantil precoce identificado entre a população brasileira, uma grave e rara doença de depósito lisossomal, com apenas 12 casos claramente descritos mundialmente. Estudos clínicos, patológicos e bioquímicos realizados foram consistentes com os dados já publicados na literatura científica. Detectamos a doença em uma menina de 7 meses de idade, com diagnóstico de ascite no período pré-natal e evolução compatível com doença de depósito, através da cromatografia em camada fina para oligossacarídeos, que é parte integrante do programa de triagem para erros inatos do metabolismo (EIM) em crianças de alto risco, realizado no Estado do Rio de Janeiro.

    Abstract in English:

    We present the first case of an early infantile form of galactosialidosis among Brazilians. This very rare and severe lysosomal storage disease has only a dozen patients clearly diagnosed worldwide. Clinical, pathological and biochemical features were consistent with previously published findings. We detected the disorder in a 7-month-old female baby with prenatal diagnosis of ascites. Evolution of the storage disease was monitored through routine thin-layer chromatography (TLC) for urinary oligosaccharides as part of a screening program for inborn errors of metabolism (IEM) in high-risk children, carried out in Rio de Janeiro.
  • A rapid technique for analysis of formalin-fixed, paraffin-embedded tissues by fluorescent in situ hybridization with alpha-satellite probes Human And Medical Genetics

    Barril, Nilce; Carvalho-Salles, Andréa Borduchi; Tajara, Eloiza Helena

    Abstract in Portuguese:

    Descrevemos aqui um procedimento rápido para obtenção de núcleos interfásicos a partir de amostras arquivadas que podem ser utilizados para análise citogenética através da técnica de FISH. Este procedimento difere de outros previamente descritos porque permite a obtenção de núcleos em número e qualidade satisfatórios sem a utilização de equipamentos ou lâminas especiais e soluções para descondensação da cromatina. O método é de baixo custo e possibilita estudos retrospectivos de tecidos fixados em formol e emblocados em parafina.

    Abstract in English:

    We describe a rapid procedure for preparing archival tissues for interphase FISH analysis. The present protocol differs from others previously described because it allows the obtention of nuclei in satisfactory number and quality without using special equipments, adhesive-treated slides or solutions for chromatin decondensation. The method is of low cost and useful for retrospective analyses of formalin-fixed, paraffin-embedded samples.
  • Say syndrome: A new Brazilian case Human And Medical Genetics

    Guion-Almeida, M.L.; Kokitsu-Nakata, N.M.; Zechi, R.M.

    Abstract in Portuguese:

    Os autores descrevem um menino, filho de pais normais e não-consanguíneos, apresentando baixa estatura, microcefalia, orelhas grandes, seqüência de Robin, anomalias digitais, atraso na idade óssea e atraso no desenvolvimento neuropsicomotor. Estudo cromossômico mostrou cariótipo normal, 46,XY. Os achados são compatíveis com a síndrome de Say.

    Abstract in English:

    We report on a Brazilian boy, born to nonconsanguineous parents, who presented short stature, microcephaly, large ears, Robin sequence, hand anomalies, delayed bone age, and developmental delay. Major signs found in this patient are related to the Say syndrome.
  • Molecular Cytogenetics II: PCR-based diagnosis of chromosomal deletions and microdeletion syndromes Human And Medical Genetics

    Pena, Sérgio D.J.
  • Tissue-specific expression of esterases in Triatoma infestans (Triatominae, Heteroptera) Animal Genetics

    Tavares, Mara Garcia; Azeredo-Oliveira, Maria Tercilia Vilela de; Ceron, Carlos Roberto

    Abstract in Portuguese:

    Foram examinadas as esterases presentes na hemolinfa e nos túbulos de Malpighi do "barbeiro" Triatoma infestans (Triatominae, Heteroptera) através de eletroforese em gel de poliacrilamida. No total, foram observadas seis bandas esterásicas denominadas EST 1 a EST 6. As esterases EST 1, 4, 5 e 6 foram exclusivas da hemolinfa, enquanto EST 2 e 3 foram encontradas apenas nos túbulos de Malpighi. Cada tecido apresentou um padrão esterásico característico, o qual pode estar relacionado com o seu papel funcional. As quatro esterases da hemolinfa hidrolizaram o a-naftil acetato. Uma destas enzimas foi classificada como carboxilesterase (EST 4), uma como acetilesterase (EST 6) e as outras duas enzimas podem ser carboxilesterases ou serino-proteases com função esterolítica, uma vez que elas foram inibidas seletivamente pelo PMSF (EST 1 e 5). A ausência de variabilidade genética pode ser devida à alta taxa de endocruzamentos.

    Abstract in English:

    We examined the esterases present in the hemolymph and Malpighian tubules of "Kissing bug", Triatoma infestans (Triatominae, Heteroptera) by polyacrylamide gel electrophoresis. Six esterase bands were observed and were designated EST 1 to EST 6. EST 1, 4, 5 and 6 were exclusive to hemolymph, whereas EST 2 and 3 were found only in Malpighian tubules. Each tissue had a characteristic esterase pattern, which may be related to its functional role. The four hemolymph esterases hydrolyzed a-naphthyl acetate. One of these enzymes was classified as a carboxylesterase (EST 4), and another was an acetylesterase (EST 6). The other two enzymes (EST 1 and 5) could be either carboxylesterases or serino-proteases with an esterolytic function, as they were selectively inhibited by phenylmethylsulfonyl fluoride (PMSF). Absence of genetic variability could be due to high inbreeding.
  • Study of the length of the mouthparts of Africanized, Caucasian and Africanized/Caucasian honey bee crosses, and relationships between glossa size and food gathering behavior Animal Genetics

    Pignata, Maria Izabel Barnez; Stort, Antonio Carlos; Malaspina, Osmar

    Abstract in Portuguese:

    Os comprimentos das peças que constituem o aparelho bucal, glossa, paraglossa, estipite, gálea, palpo labial, palpo maxilar, cardo, lorum, mento e pré-mento foram estudados a nível unidimensional em abelhas caucasianas, africanizadas e nos descendentes F1. Somente a paraglossa, estipite, gálea, palpo maxilar, mento e pré-mento mostraram ser diferentes entre esses 2 tipos de abelhas. Essas 6 variáveis foram estudadas nos descendentes F1, tendo sido utilizados 2 tipos de cruzamentos: rainhas caucasianas x machos africanizados (cruzamento 1) e rainhas africanizadas x machos caucasianos (cruzamento 2). Análises multidimensionais também foram realizadas, tendo sido obtidas as distâncias generalizadas de Mahalanobis (D2) entre os parentais e os descendentes F1. Tanto nas análises unidimensionais como nas multidimensionais houve aparente dominância das abelhas africanizadas, mas o número de genes não pôde ser conhecido porque só havia a geração F1 e não houve controle da heterozigosidade das 2 colônias parentais. Os cálculos dos coeficientes de correlações de Spearman mostraram que as abelhas com glossae mais longas coletaram mais xarope de açúcar e voaram mais lentamente da colônia para a fonte de alimento.

    Abstract in English:

    The lengths of the mouthparts of bees, the glossa, paraglossa, stipes, galea, labial palpus, maxillary palpus, cardo, lorum, mentum and prementum, were studied in Caucasian and Africanized bees and in their F1 descendants. Only the lengths of the paraglossa, stipe, galea, mentum, prementum and maxillary palpus differed significantly between these two bee types. These six variables were studied in the F1 descendants of two types of crosses, i.e., Caucasian queens x Africanized males (cross 1) and Africanized queens x Caucasian males (cross 2). Multidimensional analyses were also performed and the generalized Mahalanobis distances (D2) between the F1 descendants and the parental lines were determined. There was an apparent dominance of Africanized bees in both unidimensional and multidimensional analyses. Correlation analysis showed that bees with longer glossae collected more food (sugar syrup) and flew more slowly from the colony to the food source.
  • Use of lymphocyte cultures for BrdU replication banding patterns in anuran species (Amphibia) Animal Genetics

    Kasahara, Sanae; Silva, Ana Paula Zampieri; Gruber, Simone Lilian

    Abstract in Portuguese:

    Descreve-se a padronização da cultura de linfócitos com a finalidade de melhorar as preparações citológicas de espécies de anfíbios anuros. Esta metodologia permite o uso do tratamento pelo BrdU para se obter padrões de bandas de replicação nos cromossomos dessas espécies.

    Abstract in English:

    We describe the standardization of lymphocyte culture procedures in order to improve cytological preparations of anuran species. This methodology permits the use of 5-bromodeoxyuridine (BrdU) treatment to obtain replication banding patterns in the chromosomes of these species.
  • Effect of self-fertilization on Biomphalaria tenagophila (Orbigny, 1835) (Pulmonata: Planorbidae) Animal Genetics

    Tuan, Roseli; Simões, Luiz Carlos Gomes

    Abstract in Portuguese:

    A Biomphalaria tenagophila é um caramujo hermafrodita simultâneo com potencial para a autofecundação e fecundação cruzada. É portanto, um excelente objeto de estudo sobre o modo de reprodução como estratégia evolutiva. Neste trabalho comparamos a quarta geração produzida sucessivamente por autofecundação a animais cruzados em relação ao tamanho da concha na maturidade sexual, à fecundidade e à fertilidade dos ovos. Os parâmetros reprodutivos analisados apresentaram semelhança nos dois grupos. No entanto, o tamanho da concha na maturidade sexual foi significativamente maior na quarta geração produzida por sucessivas autofecundações.

    Abstract in English:

    Biomphalaria tenagophila is a simultaneous hermaphrodite freshwater snail, which can breed by self and cross-fertilization. It is, therefore, well suited for studying reproduction as an evolutive strategy. Several characteristics (shell size and age at sexual maturity, egg fecundity and fertility) were analyzed in four consecutive self-fertilized generations and compared to cross-fertilized individuals. The reproductive parameters were similar in the two groups. Shell size was significantly greater in the fourth self-fertilized generation than in the cross-fertilized individuals.
  • Orthogonal projections and bootstrap resampling procedures in the study of infraspecific variation Animal Genetics

    Duarte, Luiza Carla; Von Zuben, Fernando José; Reis, Sérgio Furtado dos

    Abstract in Portuguese:

    A influência do aumento em caracteres quantitativos contínuos devido ao crescimento indeterminado sobre a análise de diferenciação entre populações foi investigado utilizando como exemplo um conjunto de dados de variáveis craniométricas em 10 populações de uma espécie de roedor. Dois conjuntos de dados, um não corrigido para o efeito alométrico do tamanho e um outro corrigido para o efeito alométrico do tamanho utilizando um método de projeção ortogonal, foram analisados por um procedimento "bootstrap" de reamostragem aplicado à análise de variáveis canônicas. O componente de variância devido ao crescimento indeterminado dentro das populações foi significativo para a maioria das medidas de distâncias, o que não influenciou a ordenação das populações, conforme evidenciado pela posição relativa dos centróides. O padrão de covariância entre as variáveis de distância que foi utilizado para inferir a natureza das diferenças morfológicas foi, no entanto, fortemente influenciado pela variação nas medidas de distâncias dentro das populações. O conjunto de dados não corrigido resultou em uma interpretação errônea sobre a natureza da diferenciação morfológica, sugerindo que as populações diferiram somente em tamanho. O conjunto de dados corrigido para o efeito alométrico, por sua vez, demonstrou claramente que as populações diferiram, não somente no tamanho, mas também na forma. Os resultados são discutidos em termos da diferenciação das populações em forma e tamanho no contexto da definição das unidades geográficas infraspecíficas.

    Abstract in English:

    The effect of an increase in quantitative continuous characters resulting from indeterminate growth upon the analysis of population differentiation was investigated using, as an example, a set of continuous characters measured as distance variables in 10 populations of a rodent species. The data before and after correction for allometric size effects using orthogonal projections were analyzed with a parametric bootstrap resampling procedure applied to canonical variate analysis. The variance component of the distance measures attributable to indeterminate growth within the populations was found to be substantial, although the ordination of the populations was not affected, as evidenced by the relative and absolute positions of the centroids. The covariance pattern of the distance variables used to infer the nature of the morphological differences was strongly influenced by indeterminate growth. The uncorrected data produced a misleading picture of morphological differentiation by indicating that groups of populations differed in size. However, the data corrected for allometric effects clearly demonstrated that populations differed morphologically both in size and shape. These results are discussed in terms of the analysis of morphological differentiation among populations and the definition of infraspecific geographic units.
  • Analysis of genetic variability in three species of Pimelodidae (Ostariophysi - Siluriformes) Animal Genetics

    Almeida, Fernanda S. de; Sodré, Leda M.K.

    Abstract in Portuguese:

    A variabilidade genética de 3 espécies da família Pimelodidae, Pimelodus maculatus, Iheringichthys labrosus e Pinirampus pirinampu, coletadas em um ponto do rio Tibagi, foi analisada comparativamente utilizando dados protéicos de 6 sistemas que codificam 15 locos em fígado, músculo e coração. A proporção de locos polimórficos (<img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/21n4a14.jpg" alt="21n4a14.jpg (768 bytes)" align="middle">) para P. maculatus, I. labrosus e P. pirinampu foi de 13,33, 20 e 6,67%, respectivamente, e a heterozigosidade média foi de 6, 8,3 e 4,3%. A identidade genética (I) foi de 0,32 entre P. maculatus e I. labrosus, 0,37 entre P. maculatus e P. pirinampu e 0,58 entre I. labrosus e P. pirinampu. O valor de I (0,58) encontrado entre I. labrosus e P. pirinampu sugere que estas são espécies congenéricas. No entanto, as características morfológicas colocam estas espécies em gêneros distintos. Os resultados obtidos nesse estudo podem ser úteis para um melhor conhecimento de espécies de Pimelodidae. Elas também reforçam a necessidade da preservação do rio Tibagi (Paraná - Brasil) através de uma análise cuidadosa no caso de construção de hidroelétricas.

    Abstract in English:

    Genetic variability of three Pimelodidae species, Pimelodus maculatus, Iheringichthys labrosus, and Pinirampus pirinampu, collected at one site in the Tibagi River, was comparatively analyzed using protein data for six systems which code 15 loci in liver, muscle, and heart. The proportion of polymorphic loci (<img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/21n4a14.jpg" alt="21n4a14.jpg (768 bytes)" align="middle">) for P. maculatus, I. labrosus, and P. pirinampu was 13.33, 20, and 6.67%, respectively, and mean heterozigosity was 6, 8.3, and 4.3%. The genetic identity value (I) was 0.32 between P. maculatus and I. labrosus, 0.37 between P. maculatus and P. pirinampu, and 0.58 between I. labrosus and P. pirinampu. This value suggests that these two latter species are congeneric. However, morphological characteristics place these species in distinct genera.
  • Molecular biogeography of the Neotropical fish Hoplias malabaricus (Erythrinidae:Characiformes) in the Iguaçu, Tibagi, and Paraná Rivers Animal Genetics

    Dergam, Jorge A.; Suzuki, Harumi Irene; Shibatta, Oscar A.; Duboc, Luiz F.; Júlio Jr, Horácio F.; Giuliano-Caetano, Lúcia; Black IV, William C.

    Abstract in Portuguese:

    Hoplias malabaricus, a traíra, colonizou o Rio Iguaçu nas últimas décadas. Numa tentativa de determinar os níveis de diferenciação genética deste taxon nominal em bacias vizinhas, assim como a origem da população colonizadora, foram analisados os padrões de similaridade de marcadores genômicos do tipo randomly amplified polymorphic DNA-polymerase chain reaction (RAPD-PCR) de amostras dos rios Paraná, Iguaçu, e Tibagi. As amostras do Paraná e do Tibagi apresentaram elevados índices de diversidade genética, os quais sugerem a ocorrência de espécies diferentes nestes rios. Todos os alelos presentes na população da cabeceira do rio Tibagi ocorreram também na amostra do rio Iguaçu. Esta semelhança permite-nos sugerir que a população da cabeceira do rio Tibagi (ou alguma população com características genéticas semelhantes) possa ser a origem da população amostrada no rio Iguaçu.

    Abstract in English:

    Hoplias malabaricus, the common trahira, extended its range into the Iguaçu River sometime in the last decades. To determine levels of genetic differentiation in neighboring basins of this nominal taxon, as well as to unveil the source of the invading population, we analyzed patterns of similarity of RAPD-PCR genomic markers of samples from Paraná, Iguaçu and Tibagi Rivers. The high genetic diversity of samples from the Paraná and Tibagi Rivers suggested strong population structuring or even the occurrence of undescribed species. All alleles of the sample from the headwaters of Tibagi River were present in the sample from the Iguaçu River, which suggests that the former population or another population with similar genetic makeup, may be the source of the trahiras of the Iguaçu River.
  • Multiple soluble malate dehydrogenase of Geophagus brasiliensis (Cichlidae, Perciformes) Animal Genetics

    Aquino-Silva, Maria Regina de; Schwantes, Maria Luiza B.; Schwantes, Arno Rudi

    Abstract in Portuguese:

    A fim de explicar o padrão eletroforético de seis componentes detectado para a malato desidrogenase solúvel (MDH, EC 1.1.1.37) em 84% dos exemplares de G. brasiliensis analisados (Cichlidae, Perciformes), uma duplicação recente no loco sMDH-B* é sugerida. Diluições seriadas de Klebe realizadas com extratos de músculo esquelético mostraram para as subunidades B1 e B2 o mesmo ponto final visual sugerindo um padrão de expressão não divergente para esses genes duplicados. Uma vez que não existe evidência de poliploidia na família Cichlidae, é sugerido que a duplicação no loco sMDH-B* seja resultante de uma duplicação regional. Especificidade tissular, termoestabilidade e propriedades cinéticas mostraram-se similares para as isoformas B, em ambos os fenótipos detectados, sugerindo estarem esses sob a ação do mesmo gene regulador. Os resultados similares obtidos para os fenótipos de três (AB1) e seis (AB1B2) componentes aqui analisados não mostraram nenhum indicativo de vantagem adaptativa deste último sobre o primeiro, em região subtropical.

    Abstract in English:

    A recent locus duplication hypothesis for sMDH-B* was proposed to explain the complex electrophoretic pattern of six bands detected for the soluble form of malate dehydrogenase (MDH, EC 1.1.1.37) in 84% of the Geophagus brasiliensis (Cichlidae, Perciformes) analyzed (AB1B2 individuals). Klebe's serial dilutions were carried out in skeletal muscle extracts. B1 and B2 subunits had the same visual end-points, reflecting a nondivergent pattern for these B-duplicated genes. Since there is no evidence of polyploidy in the Cichlidae family, MDH-B* loci must have evolved from regional gene duplication. Tissue specificities, thermostability and kinetic tests resulted in similar responses from both B-isoforms, in both sMDH phenotypes, suggesting that these more recently duplicated loci underwent the same regulatory gene action. Similar results obtained with the two sMDH phenotypes did not show any indication of a six-banded specimen adaptive advantage in subtropical regions.
  • Embryology and cytogenetics of Eupatorium pauciflorum and E. intermedium (Compositae) Plant Genetics

    Bertasso-Borges, Maristela Sanches; Coleman, James Robert

    Abstract in Portuguese:

    Os estudos embriológicos indicam que Eupatorium pauciflorum apresenta diplosporia com desenvolvimento autônomo do endosperma. O saco embrionário é do tipo polygonum e os núcleos polares se fundem antes da antese. A ocorrência de embrionia precoce e desenvolvimento do endosperma em flores fechadas, e a total ausência de grãos de pólen germinados em estigmas expostos, bem como a ausência de tubos polínicos nos óvulos, indicam que agamospermia é obrigatória e o desenvolvimento do embrião e do endosperma é autônomo. O estudo da microsporogênese revelou completa ausência de produção de pólen, em razão da degeneração dos microsporócitos antes do início da meiose, o que resulta em absoluta esterilidade masculina. E. pauciflorum demonstrou ser autotriplóide com um conjunto básico de 10 cromossomos repetidos três vezes. Os estudos embriológicos mostraram que E. intermedium sofre meiose reducional, com formação de tétrades durante a megasporogênese, seguida pelo desenvolvimento monospórico do saco embrionário do tipo polygonum. Os núcleos polares se fundem antes da antese. A oosfera invariavelmente permanece até a antese sem se dividir, impedindo a ocorrência de embrionia precoce. A meiose da microsporogênese resulta na formação regular de 10 bivalentes; os estágios subseqüentes da microsporogênese são normais e a análise da superfície estigmática indica a ocorrência regular de polinização, com grãos de pólen viáveis e funcionais. Estudos de cariótipo revelaram um complemento de 20 cromossomos separados em 10 pares. É possível concluir que E. pauciflorum, como representada pelo material estudado, é apomítica, enquanto E. intermedium é sexuada.

    Abstract in English:

    The embryology of Eupatorium pauciflorum indicates diplospory with autonomous endosperm development. The embryo sac is of the polygonum type and the polar nuclei mostly fuse before anthesis. The occurrence of precocious embryo and endosperm development in unopened florets, and the total absence of germinated pollen grains on exposed stigmas, as well as the absence of pollen tubes in the ovules, indicate agamospermy to be obligate and embryo and endosperm development autonomous. The study of microsporogenesis revealed the total absence of pollen production in consequence of microsporocyte degeneration before the onset of meiosis, which resulted in absolute male sterility. E. pauciflorum was demonstrated to be an autotriploid with a basic set of 10 chromosomes, each represented three times. Embryological studies showed E. intermedium to undergo reductive meiosis with tetrad formation during megasporogenesis, followed by monosporic embryo sac development of the polygonum type. The polar nuclei fuse before anthesis. The egg cell invariably attains anthesis still undivided, without precocious embryony. Meiosis of microsporogenesis results in the regular formation of 10 bivalents and the subsequent stages of microsporogenesis are normal. Stigmatic loads indicate the regular occurrence of pollination with viable, functional grains. Karyotypic studies revealed a complement of 20 chromosomes separable into 10 pairs. It is concluded that E. pauciflorum, as represented by the material studied, is apomictic while E. intermedium is sexual.
  • Early selection for growth vigor in rubber tree genotypes in northwestern São Paulo State (Brazil) Plant Genetics

    Gonçalves, Paulo de Souza; Bortoletto, Nelson; Fonseca, Fernando da Silva; Bataglia, Ondino Cleante; Ortolani, Altino Aldo

    Abstract in Portuguese:

    Quarenta e cinco genótipos (clones) de seringueira [Hevea brasiliensis (Willd. ex Adr. de Juss.) Müell. Arg.] de diferentes origens foram avaliados para eficiência de seleção precoce na região noroeste do Estado de São Paulo. O ensaio foi conduzido na Estação Experimental de Votuporanga utilizando delineamento em blocos ao acaso com três repetições e seis plantas por parcela. O perímetro do caule de cada árvore/clone foi tomado a 120 cm de altura do calo de enxertia nas idades de 12, 24, 36, 48, 60, 72, 84 e 96 meses. Os resultados mostraram diferenças altamente significativas entre genótipos para todas as idades avaliadas exceto aos 12 meses. As estimativas da variância genética para idades combinadas mostraram um aumento substancial ao longo das idades, enquanto que as variâncias da interação genótipo x idade mostraram comportamento inverso. A seleção conduzida aos 24 meses mostrou melhor eficiência, propiciando um ganho superior por unidade de tempo. Os resultados da metodologia utilizada da seleção precoce mostraram que essa estratégia pode ser utilizada no melhoramento genético da seringueira.

    Abstract in English:

    Forty-five genotypes (clones) of rubber tree [Hevea brasiliensis (Willd. ex Adr. de Juss.) Müell. Arg.] of different origins were assessed for efficiency of early selection at the Votuporanga Experimental Station in northwestern São Paulo State, Brazil, using a randomized complete block design with three replications and six plants per plot. Girth at 120 cm above the highest point of the grafting union of each tree was taken at ages 12, 24, 36, 48, 60, 72, 84 and 96 months. Highly significant differences in girth were detected among the genotypes at all ages evaluated, except for 12 months. Estimates of genetic variance for two age sets showed a substantial increase with age, while the genotype variation decreased. Selection made at 24 months proved to be the most efficient, giving a superior gain per unit of time.
  • Hermaphroditism in the rubber tree Hevea brasiliensis (Willd. ex Adr. de Juss.) Muell. Arg. - II Plant Genetics

    Cuco, Silvia Marina; Bandel, Gerhard

    Abstract in Portuguese:

    Flores de três clones de Hevea brasiliensis, RRIM 527, RRIM 600 e GT 1, foram analisadas, sob lupa e microscopia eletrônica de varredura, a fim de se observar as taxas de ocorrência de hermafroditismo. Os resultados mostraram um total de 71,49% de flores hermafroditas, sendo que destas 29,83% apresentaram anteras residuais, não completamente desenvolvidas. As análises ao microscópio de varredura não mostraram diferença ao nível de epiderme de anteras em flores masculinas e hermafroditas de RRIM 527 e RRIM 600. No clone GT 1 (macho estéril) a epiderme das anteras mostrou-se frouxa já no início do desenvolvimento floral e completamente enrugada ao final da maturação, demonstrando que as anteras estão vazias neste estádio.

    Abstract in English:

    Flowers of three Hevea brasiliensis clones, RRIM 527, RRIM 600 and GT 1, were analyzed under stereomicroscope and scanning electron microscope, aiming to observe hermaphroditism rates. Results showed 71.49% hermaphrodite flowers, 29.83% of which exhibited incompletely developed, residual anthers. The scanning electron microscope analysis did not detect differences in anther epidermis of male and bisexual flowers of RRIM 600 and RRIM 527. In GT 1 clone (sterile male), the anther epidermis was already weak at the beginning of floral development and completely wrinkled at the end of maturation. Consequently, the anthers were empty by this stage.
  • Evidence of apomixis in cassava (Manihot esculenta Crantz) Plant Genetics

    Nassar, Nagib M.A.; Vieira, Marco André R.; Vieira, Clibas; Gratapaglia, Dario

    Abstract in Portuguese:

    A Apomixia mantém a heterose e evita a transmissão de patógenos sistêmicos que acompanham a propagação vegetativa da mandioca. Um estudo embriônico de ovos clareados de dois clones de mandioca in toto mostrou que eles são de natureza apospórica. A análise citogenética dos 2 clones revelou uma estrutura aneuploide (2n + 1) em indivíduos apomíticos, ao passo que era 2n em plantas reproduzidas sexualmente.

    Abstract in English:

    Apomixis maintains heterosis and avoids transmission of systemic pathogens which accompany vegetative propagation of cassava. An embryonic study of cleared ovules of two cassava clones in toto showed them to be of aposporic nature. Cytogenetic analysis of the two clones revealed an aneuploid structure (2n + 1) in apomictic individuals, whereas it was 2n in the sexually reproduced plants.
  • Use of seed protein polymorphism for discrimination of improvement level and geographic origin of upland rice cultivars Plant Genetics

    Montalván, Ricardo; Ando, Akihiko; Echeverrigaray, Sérgio

    Abstract in Portuguese:

    Proteínas de grão de 58 genótipos de arroz brasileiro e nove japoneses foram separadas por meio de eletroforese (SDS-PAGE). A observação densitométrica dos perfis eletroforéticos permitiu avaliar as concentrações relativas de 16 frações protéicas que foram usadas como variáveis para a estimativa de funções discriminantes de Fisher. Diferenças significantes foram encontradas entre as frações protéicas dos grupos brasileiros e japoneses, assim como entre os genótipos melhorados e não melhorados. O polimorfismo protéico detectável eletroforetica-mente nos grãos de arroz pode indicar a origem geográfica e o nível de melhoramento dos cultivares.

    Abstract in English:

    Grain proteins from 58 Brazilian and nine Japanese upland rice cultivars (Oryza sativa L.) were electrophoretically separated by sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE). Densitometric scanning of the electrophoretic profiles permitted the estimation of the relative concentration of 16 protein fractions, which were used as variables for the calculation of Fisher's canonical discriminating functions. Significant differences between mean values of protein fractions were useful in distinguishing Brazilian and Japanese cultivars, as well as improved and non-improved Brazilian rice cultivars in scattered plots. Electrophoretically detectable protein polymorphism in rice grain can indicate geographic origin as well as breeding improvement level of a cultivar. Improved cultivars were those released by plant breeding institutes.
  • Genetic variance and covariance components related to intra- and interpopulation recurrent selection in maize (Zea mays L.) Plant Genetics

    Arias, Carlos Alberto Arrabal; Souza Júnior, Cláudio Lopes de

    Abstract in Portuguese:

    Novos componentes genéticos de variância e covariância relacionados aos métodos de seleção recorrente intra- e interpopulacional foram desenvolvidos teoricamente por Souza Jr. (Rev. Bras. Genet. 16: 91-105, 1993) para explicar porque estes métodos têm falhado em melhorar o híbrido e as populações per se conjuntamente. Progênies de meio-irmãos intra- e interpopulacionais foram produzidas a partir de 100 genótipos amostrados das populações de milho BR-106 e BR-105 para estimar estes componentes de variância e covariância e comparar as respostas esperadas para os métodos de seleção recorrente recíproca (RRS), intrapopulacional (HSS) e modificada (MRS) sobre o híbrido interpopulacional, as populações per se e a heterose. Quatro grupos de 100 progênies, dois intra- e dois interpopulacionais, foram avaliados em látices 10 x 10, parcialmente balanceados, arranjados segundo um delineamento em faixas com duas repetições, nos anos agrícolas 1991-1992 e 1992-1993 e em dois locais da região de Piracicaba, SP. Foram avaliados os seguintes caracteres: peso de espiga, alturas de planta e espiga e a razão altura de planta sobre altura de espiga. As populações e os híbridos interpopulacionais apresentaram alta produtividade e grande potencial para a produção de híbridos de linhagens. As heteroses em relação à média populacional e à melhor população foram relativamente altas, mas abaixo dos valores relatados para estas populações sob outras condições ambientais. As estimativas da variância aditiva para as populações per se e para os cruzamentos interpopulacionais confirmaram o grande potencial desses materiais para o melhoramento. As magnitudes das estimativas da variância para os desvios dos efeitos aditivos intra- e interpopulacionais (<img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1918f1.jpg" alt="1918f1.jpg (1262 bytes)" align="middle"> para BR-106 e <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1918f3.jpg" alt="1918f3.jpg (1259 bytes)" align="middle"> para BR-105) e para a covariância entre os efeitos aditivos com esses desvios (<img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1918f2.jpg" alt="1918f2.jpg (2022 bytes)" align="middle"> para BR-106 e <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1918f4.jpg" alt="1918f4.jpg (1995 bytes)" align="middle"> para BR-105) indicaram que estes novos componentes podem influenciar significativamente a eficiência dos métodos de melhoramento. As estimativas dos componentes genéticos para BR-105 apresentaram erros relativamente pequenos, com <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1918f4.jpg" alt="1918f4.jpg (1995 bytes)" align="middle"> negativo para todos os caracteres. As estimativas de <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1918f1.jpg" alt="1918f1.jpg (1262 bytes)" align="middle"> e <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1918f2.jpg" alt="1918f2.jpg (2022 bytes)" align="middle"> apresentaram erros relativamente grandes para BR-106. O método MRS foi mais eficiente que RRS e HSS para a produção de híbridos de linhagens. A escolha da população testadora para o método MRS baseada apenas nas médias das populações per se pode ser incorreta. Quando possível, a utilização adicional das variâncias genéticas aditivas intra- e interpopulacionais de cada população seria mais apropriada.

    Abstract in English:

    New genetic variance and covariance components related to intra- and interpopulational recurrent selection methods have been theoretically developed by Souza Jr. (Rev. Bras. Genet. 16: 91-105, 1993) to explain the failure of these methods to concomitantly develop hybrid and per se populations. Intra- and interpopulation half-sib progenies of 100 genotypes were sampled from maize (Zea mays L.) populations BR-106 and BR-105 to estimate variance and covariance components and to compare the expected responses to reciprocal (RRS), intrapopulational (HSS), and modified (MRS) recurrent selection in interpopulation hybrid, populations per se, and to determine heterosis. Four sets of 100 progenies, two intra- and two interpopulational, were evaluated in partially balanced 10 x 10 lattices arranged in split-blocks with two replications in two years (1991/92 and 1992/93) and two locations in Piracicaba, SP. Data for ear weight, plant and ear height, and ear by plant height ratio were recorded. Populations and interpopulation crosses were high yielding and showed high breeding potential for production of hybrids from inbred lines. Mid parent and the highest parent heterosis were relatively high, but lower than values reported for these populations under other environmental conditions. Additive variance estimates of populations per se and interpopulation crosses confirmed the high potential of these materials. The magnitude of the variance estimates for the deviations from intra- and interpopulation additive effects (<img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1918f1.jpg" alt="1918f1.jpg (1262 bytes)" align="middle"> for BR-106 and <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1918f3.jpg" alt="1918f3.jpg (1259 bytes)" align="middle">for BR-105) and covariance between additive effects with these deviations (<img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1918f2.jpg" alt="1918f2.jpg (2022 bytes)" align="middle"> for BR-106 and <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1918f4.jpg" alt="1918f4.jpg (1995 bytes)" align="middle"> for BR-105) indicated that these new components can significantly influence the effectiveness of breeding methods. Genetic component estimates for BR-105 had relatively small errors, with <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1918f4.jpg" alt="1918f4.jpg (1995 bytes)" align="middle"> negative for all traits. Estimates of <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1918f1.jpg" alt="1918f1.jpg (1262 bytes)" align="middle">and <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1918f2.jpg" alt="1918f2.jpg (2022 bytes)" align="middle"> had relatively larger errors for BR-106. The MRS method was more effective than the RRS and HSS methods in producing hybrids from inbred lines. The choice of a population tester for the MRS method based on population means per se may be incorrect. The additional use, when possible, of intra- and interpopulation additive genetic variances from each population would be more appropriate.
  • Screening cotton genotypes for seedling drought tolerance Plant Genetics

    Penna, Julio C. Viglioni; Verhalen, Laval M.; Kirkham, M.B.; McNew, Ronald W.

    Abstract in Portuguese:

    Os objetivos desta pesquisa foram adaptar para o algodoeiro (Gossypium hirsutum L.) técnica de seleção previamente usada para avaliar tolerância à seca em plântulas de cereais e identificar acessos tolerantes entre uma gama de germoplasmas. Noventa diferentes genótipos foram avaliados em sete experimentos em câmara de crescimento. Plântulas de 15 dias de idade foram submetidas a ciclos de estresse hídrico de 4 dias e os índices de sobrevivência foram avaliados para cada ciclo. Três ciclos são o mínimo para se trabalhar com algodoeiro. Diferenças significativas (P < 0,05%) entre acessos foram obtidas em quatro dos sete experimentos. Um teste de confirmação foi executado, composto de entradas previamente classificadas como "tolerantes" (alta sobrevivência) e "suscetíveis" (baixa sobrevivência). Um número de entradas duplicou seu desempenho anterior mas outras não, o que indicou a necessidade de reavaliar as seleções. Em geral, a técnica é simples, embora exigente em tempo, e tem valor prático para avaliar grande número de genótipos. Os resultados dos testes avaliatórios geralmente coincidiram com informações subjetivas de campo. Entre outros, os germoplasmas considerados tolerantes foram: `IAC-13-1', `IAC-RM4-SM5', `Minas Sertaneja', `Acala 1517E-1' e `4521'. Esta pesquisa também demonstrou a necessidade de se caracterizar a falta de uniformidade nos ambientes das câmaras de crescimento e assim se escolherem delineamentos experimentais adequados. O procedimento de seleção descrito é adequado para selecionar entradas tolerantes dentre grande número de acessos em coleções de germoplasma e como passo preliminar em programas de melhoramento para tolerância à seca.

    Abstract in English:

    The objectives of this study were to adapt a screening method previously used to assess seedling drought tolerance in cereals for use in cotton (Gossypium hirsutum L.) and to identify tolerant accessions among a wide range of genotypes. Ninety genotypes were screened in seven growth chamber experiments. Fifteen-day-old seedlings were subjected to four 4-day drought cycles, and plant survival was evaluated after each cycle. Three cycles are probably the minimum required in cotton work. Significant differences (at the 0.05 level or lower) among entries were obtained in four of the seven experiments. A "confirmation test" with entries previously evaluated as "tolerant" (high survival) and "susceptible" (low survival) was run. A number of entries duplicated their earlier performance, but others did not, which indicates the need to reevaluate selections. Germplasms considered tolerant included: `IAC-13-1', `IAC-RM4-SM5', `Minas Sertaneja', `Acala 1517E-1' and `4521'. In general, the technique is simple, though time-consuming, with practical value for screening a large number of genotypes. Results from the screening tests generally agreed with field information. The screening procedure is suitable to select tolerant accessions from among a large number of entries in germplasm collections as a preliminary step in breeding for drought tolerance. This research also demonstrated the need to characterize the internal lack of uniformity in growth chambers to allow for adequate designs of experiments.
  • A new method to estimate genetic gain in annual crops Plant Genetics

    Breseghello, Flávio; Morais, Orlando Peixoto de; Rangel, Paulo Hideo Nakano

    Abstract in Portuguese:

    Os ganhos genéticos obtidos pelo melhoramento de caracteres quantitativos podem ser estimados utilizando resultados de ensaios regionais de avaliação de linhagens e cultivares. Um novo método estatístico para esta estimativa é proposto, o qual consiste em quatro passos: a) análise conjunta da série de dados dos ensaios regionais através de um modelo linear generalizado de forma a obter as médias ajustadas dos genótipos e a matriz de covariâncias destas médias; b) para o grupo de genótipos avaliados em cada ano, cálculo da média aritmética das médias ajustadas obtidas na análise conjunta; c) comparação direta dos anos, conforme as médias aritméticas obtidas, e d) estimativa de um ganho genético médio, por regressão. Aplicando-se o método de quadrados mínimos generalizado, é calculada uma estimativa ponderada do ganho genético médio no período. Este método permite um melhor cancelamento das interações genótipo x ano e genótipo x ensaio/ano, resultando assim em estimativas mais precisas. Este método pode ser aplicado a dados desbalanceados, o que possibilita a estimativa dos ganhos genéticos em séries de ensaios multilocais de qualquer amplitude e duração.

    Abstract in English:

    The genetic gain obtained by breeding programs to improve quantitative traits may be estimated by using data from regional trials. A new statistical method for this estimate is proposed and includes four steps: a) joint analysis of regional trial data using a generalized linear model to obtain adjusted genotype means and covariance matrix of these means for the whole studied period; b) calculation of the arithmetic mean of the adjusted genotype means, exclusively for the group of genotypes evaluated each year; c) direct year comparison of the arithmetic means calculated, and d) estimation of mean genetic gain by regression. Using the generalized least squares method, a weighted estimate of mean genetic gain during the period is calculated. This method permits a better cancellation of genotype x year and genotype x trial/year interactions, thus resulting in more precise estimates. This method can be applied to unbalanced data, allowing the estimation of genetic gain in series of multilocational trials.
  • Estimation of the proportion of genetic variance explained by molecular markers Plant Genetics

    Bearzoti, Eduardo; Vencovsky, Roland

    Abstract in Portuguese:

    A estimação da proporção da variância genética explicada por marcadores moleculares (p) desempenha um importante papel em estudos básicos de características quantitativas, bem como na seleção assistida por marcadores (SAM), se o índice de seleção proposto por Lande e Thompson (Genetics 124: 743-756, 1990) é utilizado. Freqüentemente, o coeficiente de determinação (R2) é usado para quantificar esta proporção. Neste trabalho, um estimador simples de p é apresentado, o qual é aplicável quando um modelo de regressão múltipla é utilizado e progênies são avaliadas em delineamentos experimentais. A sua distribuição de amostragem foi obtida e comparada com aquela do R2. Simulações de Monte Carlo sugeriram que, quando o número de progênies avaliadas é pequeno, ambas as estatísticas são insatisfatórias, devido a tendenciosidades e/ou baixa precisão. O coeficiente R2 mostrou-se adequado apenas quando p é alta. Se o número de progênies avaliadas é elevado (algumas centenas), então o estimador proposto <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1974f1.jpg" alt="1974f1.jpg (1159 bytes)" align="middle"> mostrou-se superior, com tendenciosidade consideravelmente menor que a do R2, e com precisão aceitável. Uma aproximação normal da distribuição de amostragem de <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1974f1.jpg" alt="1974f1.jpg (1159 bytes)" align="middle"> foi obtida, utilizando a expansão de Taylor da esperança e da variância dessa estatística. Intervalos de confiança aproximados para p, baseados na distribuição normal, mostraram-se satisfatórios, se o número de progênies for elevado. O uso de <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1974f1.jpg" alt="1974f1.jpg (1159 bytes)" align="middle"> na SAM é ilustrado para a estimativa do coeficiente dado ao escore molecular, se um índice de seleção é utilizado.

    Abstract in English:

    Estimation of the proportion of genetic variance explained by molecular markers (p) plays an important role in basic studies of quantitative traits, as well as in marker-assisted selection (MAS), if the selection index proposed by Lande and Thompson (Genetics 124: 743-756, 1990) is used. Frequently, the coefficient of determination (R2) is used to account for this proportion. In the present study, a simple estimator of p is presented, which is applicable when a multiple regression approach is used, and progenies are evaluated in replicated trials. The associated sampling distribution was obtained and compared with that of R2. Simulations indicated that, when the number of evaluated progenies is small, the statistics are not satisfactory, in general, due to bias and/or low precision. Coefficient R2 was found adequate in situations where p is high. If a large number of progenies is evaluated (say, a few hundreds), then the proposed estimator <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1974f1.jpg" alt="1974f1.jpg (1159 bytes)" align="middle"> appears to be better, with acceptable precision and considerably lower bias than R2. A normal approximation to the sampling distribution of <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1974f1.jpg" alt="1974f1.jpg (1159 bytes)" align="middle"> is given, using Taylor's expansion of the expectation and variance of this statistic. Approximate confidence intervals for p, based on normal distribution, are reasonable, if the number of progenies is large. The use of <img src="http:/img/fbpe/gmb/v21n4/1974f1.jpg" alt="1974f1.jpg (1159 bytes)" align="middle"> in MAS is illustrated for estimation of the weight given to the molecular score, when a selection index is used.
  • Mutagenic activation of CL64,855, an anti-Trypanosoma cruzi nitroderivant, by bacterial nitroreductases Mutation And Mutagenesis

    Morais Jr., Marcos Antonio de; Ferreira, Rita de Cássia Café; Ferreira, Luiz Carlos de Souza

    Abstract in Portuguese:

    O derivado nitroimidazol-tiodiazol CL64,855 tem uma alta atividade anti-Trypanosoma cruzi. O CL64,855 induziu uma resposta mutagênica nas linhagens TA98 e TA98dnp6, mas não na linhagem deficiente em nitrorredutase do tipo I TA98nr. Esta perda da ativação mutagênica foi acompanhada pelo aumento da sobrevivência celular aos efeitos citotóxicos da droga. A presença da fração microssomal S9 não restaurou a resposta mutagênica da TA98nr. Adicionalmente, o CL64,855 foi reduzido in vitro pela nitrorredutase I proficiente TA98, mas não pela TA98nr. Atividade mutagência foi detectada em amostras de soro pelas linhagens proficientes em nitrorredutase TA98 e TA98dnp6, mas não pela linhagem deficiente TA98nr. Em amostras de urina, a atividade mutagênica foi observada por todas as três linhagens testadas, sugerindo uma ativação metabólica in vivo do CL64,855 por diferentes rotas metabólicas.

    Abstract in English:

    CL64,855 is a nitroimidazole-thiodiazole derivate with high anti-Trypanosoma cruzi activity. CL64,855-induced mutagenesis in the Salmonella/microsome test was detected by TA98 and TA98dnp6 strains, but not by the nitroreductase I-deficient TA98nr strain. The lack of mutagenic response of TA98nr was connected with its extreme resistance to the killing effect of the drug. Presence of S9 mix did not restore mutagenic activity of CL64,855 to the TA98nr strain. Additionally, CL64,855 was reduced in vitro by the nitroreductase I-proficient TA98 strain, mainly in the presence of oxygen, but not by the TA98nr strain. Mutagenic activity was detected in serum samples of treated guinea pigs by nitroreductase-proficient strains TA98 and TA98dnp6, but not by nitroductase-deficient strain TA98nr. In the case of urine, mutagenic activity was observed with all three tested strains, suggesting an in vivo metabolic activation of the drug by a distinct metabolic pathway.
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    Costa, Sérgio Olavo Pinto da
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